RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549355.1

PTPRQ-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRQ, Length 567 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-204ENST00000549355 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 PI4K2BQ8TCG2 481 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 SOX13Q9UN79 622 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 SYNJ2O15056 1496 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 SLC7A3Q8WY07 619 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 RELTQ969Z4 430 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 GAPVD1Q14C86 1478 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 CUX1P39880 1505 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 ATP9BO43861 1147 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 NFICP08651 508 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 OGFOD3Q6PK18 319 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 SEMA6CQ9H3T2 930 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 CABP4P57796 275 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 GGNQ86UU5 652 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 HINFPQ9BQA5 517 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 VAV3Q9UKW4 847 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 U3KQE9 123 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRQ-204ENST00000549355 SYNJ1O43426 1573 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 WEE1P30291 646 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 SCNN1AP37088 669 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM26DQ5JW98 314 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 ACTL7BQ9Y614 415 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 ARHGEF11O15085 1522 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 UBAP1LF5GYI3 381 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 FOXO3O43524 673 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 PRKCQQ04759 706 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 KCNMB1Q16558 191 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 PRR23BQ6ZRT6 265 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 YIPF2Q9BWQ6 316 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 ACSS3Q9H6R3 686 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 FHAD1B1AJZ9 1412 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 ACPPP15309 386 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 MAP7Q14244 749 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 COX20Q5RI15 118 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 CYB5RLQ6IPT4 315 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 NETO1Q8TDF5 533 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 CD320Q9NPF0 282 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 TOP2BQ02880 1626 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 ADH5P11766 374 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 ERICH3Q5RHP9 1530 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 PSPNO60542 156 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 ARL4DP49703 201 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 FYB2Q5VWT5 728 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 SLC23A3Q6PIS1 610 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 VN1R5Q7Z5H4 357 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 HHIPQ96QV1 700 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 USP26Q9BXU7 913 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 NRSN2Q9GZP1 204 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM177BA6PVY3 158 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 NFKB2Q00653 900 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 DZANK1Q9NVP4 752 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 COG6Q9Y2V7 657 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 KIF27Q86VH2 1401 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRQ-204ENST00000549355 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 NCAPG2Q86XI2 1143 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM105AQ9NUU6 356 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 GRIN2AQ12879 1464 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM181AQ8N9Y4 354 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 CTNND2Q9UQB3 1225 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 CLASP1Q7Z460 1538 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 NFIBO00712 420 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 RAB6AP20340 208 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 NUP160Q12769 1436 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 DPYDQ12882 1025 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 PTK7Q13308 1070 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 KCNA10Q16322 511 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 PRDM7Q9NQW5 492 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 TRPA1O75762 1119 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms