RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462993.1

SNX10-208, Transcript of sorting nexin 10, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNX10, Length 806 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10-208ENST00000462993 CNTN3Q9P232 1028 aa6.74□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 TOP2BQ02880 1626 aa6.74□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 LINC01387J3KSC0 135 aa6.73□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 PHACTR2O75167 634 aa6.73□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 WISP1O95388 367 aa6.73□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 VAMP1P23763 118 aa6.73□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 CDC25BP30305 580 aa6.73□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 GRIK1P39086 918 aa6.73□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 FZD5Q13467 585 aa6.73□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.73□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 ACAD11Q709F0 780 aa6.73□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.73□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.73□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 GALNT11Q8NCW6 608 aa6.73□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 FBF1Q8TES7 1133 aa6.73□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 CHRDQ9H2X0 955 aa6.73□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 PARP2Q9UGN5 583 aa6.73□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 PPME1Q9Y570 386 aa6.73□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa6.72□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa6.72□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa6.72□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 HMX2A2RU54 273 aa6.72□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 NFIAQ12857 509 aa6.72□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.72□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.72□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 OR13H1Q8NG92 308 aa6.72□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 DCAF11Q8TEB1 546 aa6.72□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.72□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.72□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 GAPVD1Q14C86 1478 aa6.72□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa6.72□□□□□ -1.33
SNX10-208ENST00000462993 DAB2P98082 770 aa6.71□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 LCE1DQ5T752 114 aa6.71□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 TMC4Q7Z404 712 aa6.71□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 FRMD6Q96NE9 622 aa6.71□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 LACRTQ9GZZ8 138 aa6.71□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 BCL11AQ9H165 835 aa6.71□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 RNF19AQ9NV58 838 aa6.71□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.71□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 GRIN2BQ13224 1484 aa6.71□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 EREGO14944 169 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 SPINK2P20155 84 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 CES1P23141 567 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 GALNT12Q8IXK2 581 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 CARD10Q9BWT7 1032 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 CEP41Q9BYV8 373 aa6.7□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 WNT11O96014 354 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 GNA15P30679 374 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 RNF43Q68DV7 783 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 MUC3BQ9H195 1237 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 AK5Q9Y6K8 562 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 ARHGEF11O15085 1522 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa6.69□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 PRR19A6NJB7 356 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 GIPC1O14908 333 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 SOX18P35713 384 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 ITGAEP38570 1179 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 PSMD2Q13200 908 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 FAM161BQ96MY7 647 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.68□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 SYNJ2O15056 1496 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 ADAMTS12P58397 1594 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 SORBS3O60504 671 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 KIF4AO95239 1232 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 ATP11AP98196 1134 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 CEP135Q66GS9 1140 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 DTX1Q86Y01 620 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 DBNDD2Q9BQY9 259 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 BACH2Q9BYV9 841 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 KCNF1Q9H3M0 494 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 SPG7Q9UQ90 795 aa6.67□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 EDN3P14138 238 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 HYAL2Q12891 473 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 CYB5RLQ6IPT4 315 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 PI16Q6UXB8 463 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX10-208ENST00000462993 SHKBP1Q8TBC3 707 aa6.66□□□□□ -1.34
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