RNA–Protein interactions for RNA: YPL207W

TYW1, Iron-sulfer protein required for synthesis of Wybutosine modified tRNA, yeast

Gene TYW1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TYW1	YPL207W	SWD1	P39706	426 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	IRC5	P43610	853 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	ALF1	P53904	254 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	SRC1	Q03707	834 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	ARG3	P05150	338 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	SWI6	P09959	803 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	PCL7	P40186	285 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	GCD10	P41814	478 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	SNO4	Q04902	237 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	ARP9	Q05123	467 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	RSC2	Q06488	889 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	MCH5	Q08777	521 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	HSP32	Q08992	237 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	NFI1	Q12216	726 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	SFI1	Q12369	946 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	PTC5	Q12511	572 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	CMP2	P14747	604 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	UGA3	P26370	528 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	SET3	P36124	751 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	STL1	P39932	569 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	SKP2	P42843	763 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	SEC5	P89102	971 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	RTN2	Q12443	393 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	TSC11	P40061	1430 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
TYW1	YPL207W	IME2	P32581	645 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	TGL1	P34163	548 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	YKR051W	P36142	418 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	YBR138C	P38277	524 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	RTT105	P40063	208 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	PEX25	Q02969	394 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	YML119W	Q03208	357 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	RAD33	Q04231	177 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	YIG1	Q08956	461 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	KIP1	P28742	1111 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	GPI10	P30777	616 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	LSB6	P42951	607 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	SIP4	P46954	829 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	NIT3	P49954	291 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	YKE2	P52553	114 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	SAP4	P53036	818 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	RMT2	Q03305	412 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	ISA2	Q12425	185 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	STH1	P32597	1359 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	STE50	P25344	346 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	RIB7	P33312	244 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	SDS22	P36047	338 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	FTH1	P38310	465 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	PSF2	P40359	213 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	RIP-Chip
TYW1	YPL207W	ALY2	P47029	1046 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	NNF2	P53253	936 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	FCP1	Q03254	732 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	SWA2	Q06677	668 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	APC5	Q08683	685 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	PSF3	Q12146	194 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	TRM732	Q03496	1420 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	VTH1	P40438	1549 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	VTH2	P40890	1549 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	APN1	P22936	367 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	CLB4	P24871	460 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	RAD51	P25454	400 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	YCL002C	P25565	263 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	DAL80	P26343	269 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	PUP2	P32379	260 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	SPO22	P40511	975 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	PHO5	P00635	467 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TYW1	YPL207W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	not detected
TYW1	YPL207W	SED4	P25365	1065 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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