RNA–Protein interactions for RNA: YOR279C

RFM1, Transcript of Component of the Sum1p-Rfm1p-Hst1p complex, yeast

Gene RFM1, Length 933 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RFM1	YOR279C	IMO32	P53219	342 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFM1	YOR279C	TAF3	Q12297	353 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFM1	YOR279C	DRS2	P39524	1355 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFM1	YOR279C	PLC1	P32383	869 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFM1	YOR279C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RFM1	YOR279C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RFM1	YOR279C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RFM1	YOR279C	MTL1	P53214	551 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFM1	YOR279C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RFM1	YOR279C	COQ11	Q05892	277 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFM1	YOR279C	ARO10	Q06408	635 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFM1	YOR279C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFM1	YOR279C	RMP1	Q12530	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFM1	YOR279C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFM1	YOR279C	MPD2	Q99316	277 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFM1	YOR279C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RFM1	YOR279C	YHR112C	P38716	378 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFM1	YOR279C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RFM1	YOR279C	PEA2	P40091	420 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFM1	YOR279C	NDC80	P40460	691 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFM1	YOR279C	SNM1	P40993	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFM1	YOR279C	RET2	P43621	546 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFM1	YOR279C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RFM1	YOR279C	SGS1	P35187	1447 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RFM1	YOR279C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	KAR1	P11927	433 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	MIH1	P23748	554 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	ADY2	P25613	283 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	UBS1	P38290	277 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	FMO1	P38866	432 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	LYS9	P38999	446 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	YNL034W	P53963	612 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	YNL018C	P53976	612 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	ORC4	P54791	529 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	ATP4	P05626	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	DAL3	P32459	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	DID4	P36108	232 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	YKR051W	P36142	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	SFB3	P38810	929 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	NIT2	P47016	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	BNA2	P47125	453 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	EMP70	P32802	667 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	GLG1	P36143	616 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	NUP60	P39705	539 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	ARG2	P40360	574 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	BFA1	P47113	574 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	CTR1	P49573	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	TGL2	P54857	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	ECM9	Q02202	377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	CHD1	P32657	1468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	SPC105	P53148	917 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	YHM2	Q04013	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	PHM6	Q05637	104 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	MCM21	Q06675	368 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	UFD4	P33202	1483 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	MDM10	P18409	493 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	SPO11	P23179	398 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	NIC96	P34077	839 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	BIT2	P38346	545 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
RFM1	YOR279C	YEL020C	P39994	560 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	FHN1	P53279	174 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	ATG4	P53867	494 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	PHO11	P35842	467 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	MNN4	P36044	1178 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	APT2	P36973	181 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	PHO12	P38693	467 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	BDH2	P39713	417 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	SLD3	P53135	668 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	HOF1	Q05080	669 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RFM1	YOR279C	RPN13	O13563	156 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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