RNA–Protein interactions for RNA: YOR252W

TMA16, Transcript of Protein of unknown function that associates with ribosomes, yeast

Gene TMA16, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TMA16	YOR252W	YHR033W	P38690	423 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMA16	YOR252W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
TMA16	YOR252W	ACA1	P39970	489 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMA16	YOR252W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TMA16	YOR252W	MRPS35	P53292	345 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMA16	YOR252W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TMA16	YOR252W	TEP1	P53916	434 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMA16	YOR252W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TMA16	YOR252W	NSE5	Q03718	556 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMA16	YOR252W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TMA16	YOR252W	HIM1	Q06674	414 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMA16	YOR252W	VPS36	Q06696	566 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMA16	YOR252W	PSR2	Q07949	397 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMA16	YOR252W	PSF3	Q12146	194 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMA16	YOR252W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TMA16	YOR252W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TMA16	YOR252W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TMA16	YOR252W	IME1	P21190	360 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMA16	YOR252W	MSH1	P25846	959 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMA16	YOR252W	TGL1	P34163	548 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMA16	YOR252W	TOD6	P34219	525 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMA16	YOR252W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TMA16	YOR252W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TMA16	YOR252W	BUD8	P41698	603 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMA16	YOR252W	RGA2	Q06407	1009 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMA16	YOR252W	CDA2	Q06703	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMA16	YOR252W	ENB1	Q08299	606 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMA16	YOR252W	ECM3	Q99252	613 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMA16	YOR252W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	KIN82	P25341	720 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	DBF20	P32328	564 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	LST4	P34239	828 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	TAF5	P38129	798 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	SAP185	P40856	1058 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	BIT61	P47041	543 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	AMA1	P50082	593 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	TMA10	Q06177	86 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	ARP7	Q12406	477 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	POM34	Q12445	299 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	VPS5	Q92331	675 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	MET3	P08536	511 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	YIR042C	P40586	236 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	DLT1	Q04216	342 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	HLR1	Q04429	423 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	YLR358C	O13565	187 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
TMA16	YOR252W	STE11	P23561	717 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	MTL1	P53214	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	MDR1	P53258	950 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	MCH5	Q08777	521 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	HOS1	Q12214	470 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	ADH4	P10127	382 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	CBP3	P21560	335 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	MSM1	P22438	575 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	PEX1	P24004	1043 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	PRE4	P30657	266 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	YPT7	P32939	208 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	APM3	P38153	483 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	SWD1	P39706	426 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	GET2	P40056	285 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	MNT2	P53059	558 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	PEF1	P53238	335 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	SPO1	P53541	631 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	ERG5	P54781	538 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	NKP1	Q12493	238 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	CWH43	P25618	953 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	EXO84	P38261	753 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	PPE1	P38796	400 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	PRM2	P40534	656 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	MAD2	P40958	196 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	MAD3	P47074	515 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	MUP1	P50276	574 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	LAS17	Q12446	633 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	SSH4	P32343	579 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	LYS9	P38999	446 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	NUP60	P39705	539 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	ELO3	P40319	345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TMA16	YOR252W	BAP3	P41815	604 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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