RNA–Protein interactions for RNA: YOL063C

CRT10, Transcript of Protein involved in transcriptional regulation of RNR2 and RNR3, yeast

Gene CRT10, Length 2,874 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CRT10	YOL063C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	MST1	P07236	462 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	PCK1	P10963	549 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	TRM5	P38793	499 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	PEA2	P40091	420 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	YTA12	P40341	825 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	YJL055W	P47044	245 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	VPS70	P47161	811 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	YGR111W	P53265	400 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	MGR3	Q04472	501 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	CUR1	Q06469	252 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	TRE1	Q08919	783 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	PSF3	Q12146	194 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	GLE1	Q12315	538 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	LSO1	Q3E827	93 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	REP1	P03871	373 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	SNF3	P10870	884 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	NPP1	P25353	742 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	DUR3	P33413	735 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	UBP13	P38187	747 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	EXO5	P38289	585 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	YEL023C	P39992	682 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	ASG1	P40467	964 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	MET18	P40469	1032 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	AIM21	P40563	679 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	NUP84	P52891	726 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	PIP2	P52960	996 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	GPI17	Q04080	534 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	COQ9	Q05779	260 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	ATG26	Q06321	1198 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	YPR202W	Q08993	238 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	YLR053C	Q12026	108 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	SLX4	Q12098	748 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CRT10	YOL063C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	DGR2	P32330	852 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	TPO5	P36029	618 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	DUG2	P38149	878 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	SLM4	P38247	162 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	SHC1	P39000	512 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	RIC1	P40395	1056 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	YFH7	P43591	353 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	RCF2	P53721	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
CRT10	YOL063C	IRC3	Q06683	689 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	BUD7	Q08754	746 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	HRT3	Q12347	344 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	RGR1	P19263	1082 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	RAD14	P28519	371 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	GDA1	P32621	518 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	HSP78	P33416	811 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	GIP1	P38229	639 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	MSR1	P38714	643 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	BIR1	P47134	954 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	FOL1	P53848	824 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	UBX4	P54730	416 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	YDR476C	Q03362	224 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	SMP3	Q04174	516 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	YDR222W	Q04925	415 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	REB1	P21538	810 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	PTH2	P34222	208 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	TGL4	P36165	910 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	FMP32	P43557	207 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	IRC5	P43610	853 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	YTP1	P53584	459 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	UFO1	Q04511	668 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	RRD2	Q12461	358 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	AAD3	P25612	363 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	IRE1	P32361	1115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRT10	YOL063C	CTP1	P38152	299 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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