RNA–Protein interactions for RNA: YML118W

NGL3, Transcript of 3'-5' exonuclease specific for poly-A RNAs, yeast

Gene NGL3, Length 1,518 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NGL3	YML118W	POL3	P15436	1097 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	RSC6	P25632	483 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	AIM26	P32858	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	LRG1	P35688	1017 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	IFA38	P38286	347 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	SKN7	P38889	622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	YER010C	P40011	234 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	MNT2	P53059	558 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	ARA2	Q04212	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	TFC6	Q06339	672 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	VHS3	Q08438	674 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	DIN7	Q12086	430 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	SCM3	Q12334	223 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	VPS5	Q92331	675 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	SEM1	O94742	89 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	SIR1	P21691	654 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	YLF2	P38746	405 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	UME6	P39001	836 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	CTF18	P49956	741 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	YAP1802	P53309	568 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	YNR071C	P53757	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	ASM4	Q05166	528 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	TAH18	Q12181	623 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	CDC16	P09798	840 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	MET8	P15807	274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	PGS1	P25578	521 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	YKL050C	P35736	922 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	MRPL36	P36531	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	YBR138C	P38277	524 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	YHR078W	P38799	552 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	CTF8	P38877	133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	SAK1	P38990	1142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	CIT3	P43635	486 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	MRPL19	P53875	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	YKU80	Q04437	629 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	TRI1	Q05024	226 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	GPR1	Q12361	961 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	IME1	P21190	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	NPR3	P38742	1146 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	PEX7	P39108	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	SDP1	P40479	209 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	IRC6	P43615	237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	BUD9	P53226	547 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	RCM1	P53972	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	RSM24	Q03976	319 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	TAF11	Q04226	346 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
NGL3	YML118W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	CBF2	P32504	956 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	PET127	P32606	800 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	PEX5	P35056	612 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	SET3	P36124	751 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	YHR033W	P38690	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	PZF1	P39933	429 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	GID8	P40208	455 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	TAF4	P50105	388 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	TIM10	P87108	93 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	TIM50	Q02776	476 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	NSE5	Q03718	556 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	TRE1	Q08919	783 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	AI3	P03877	415 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	BET2	P20133	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	GTS1	P40956	396 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	PFA3	P42836	336 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	YBP2	P53169	641 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	SNO4	Q04902	237 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	TDA6	Q06466	467 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	AAD4	Q07747	329 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	HSP32	Q08992	237 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NGL3	YML118W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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