RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W TY4B-HP0C2J7 1802 aa6.16□□□□□ -1.42
VHS1YDR247W TY4B-JP47024 1803 aa6.16□□□□□ -1.42
VHS1YDR247W SPE1P08432 466 aa6.16□□□□□ -1.42
VHS1YDR247W HSP104P31539 908 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
VHS1YDR247W GCD7P32502 381 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
VHS1YDR247W MAL31P38156 614 aa6.16□□□□□ -1.42
VHS1YDR247W HXT6P39003 570 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
VHS1YDR247W HXT7P39004 570 aa6.16□□□□□ -1.42
VHS1YDR247W EMP65P40085 556 aa6.16□□□□□ -1.42
VHS1YDR247W MND2P40577 368 aa6.16□□□□□ -1.42
VHS1YDR247W SPC105P53148 917 aa6.16□□□□□ -1.42
VHS1YDR247W MET14Q02196 202 aa6.16□□□□□ -1.42
VHS1YDR247W CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
VHS1YDR247W PUS1Q12211 544 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
VHS1YDR247W CYC1P00044 109 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W FBP1P09201 348 aa6.15□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W SWE1P32944 819 aa6.15□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W HSP78P33416 811 aa6.15□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W NIC96P34077 839 aa6.15□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W ATG19P35193 415 aa6.15□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W PIP2P52960 996 aa6.15□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W PCL10P53124 433 aa6.15□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W SLD3P53135 668 aa6.15□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W HFI1Q12060 488 aa6.15□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W YPR027CQ12079 277 aa6.15□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W APM4Q99186 491 aa6.15□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W GAL10P04397 699 aa6.14□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W COX11P19516 300 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W HEM12P32347 362 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W FUI1P38196 639 aa6.14□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W ORC3P54790 616 aa6.14□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W PEX19Q07418 342 aa6.14□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W DCS2Q12123 353 aa6.14□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W MRP7P12687 371 aa6.13□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W OAF3P36023 863 aa6.13□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W CTF8P38877 133 aa6.13□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W SSY5P47002 699 aa6.13□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W UBX4P54730 416 aa6.13□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W ATG16Q03818 150 aa6.13□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W URB1P34241 1764 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W FKS3Q04952 1785 aa6.12□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W RPP2AP05319 106 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W DPB3P27344 201 aa6.12□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W SEC65P29478 273 aa6.12□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W SWC3P31376 625 aa6.12□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W YKL133CP36066 463 aa6.12□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W MRPL10P36520 322 aa6.12□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W YHR078WP38799 552 aa6.12□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W SDP1P40479 209 aa6.12□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W STU2P46675 888 aa6.12□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W MAK10Q02197 733 aa6.12□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W PEX15Q08215 383 aa6.12□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W GAL1P04385 528 aa6.11□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W PIF1P07271 859 aa6.11□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W PTP2P29461 750 aa6.11□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W MPE1P35728 441 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W YKR075CP36155 307 aa6.11□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W RIM4P38741 713 aa6.11□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W YJR039WP47107 1121 aa6.11□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W MTR3P48240 250 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W RNR4P49723 345 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W TAN1P53072 289 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W GPD1Q00055 391 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W SSL2Q00578 843 aa6.11□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W TIM50Q02776 476 aa6.11□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W VPS72Q03388 795 aa6.11□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W TPO1Q07824 586 aa6.11□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W MED7Q08278 222 aa6.11□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W TRP3P00937 484 aa6.1□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W PGI1P12709 554 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W HCA4P20448 770 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W KCC4P25389 1037 aa6.1□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W ELM1P32801 640 aa6.1□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W SER1P33330 395 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W NPR3P38742 1146 aa6.1□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W TCD1P38756 429 aa6.1□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W SSZ1P38788 538 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W ARP4P80428 489 aa6.1□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W CTF4Q01454 927 aa6.1□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W MLC2Q06580 163 aa6.1□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W ADY3Q07732 790 aa6.1□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W YOR352WQ08816 343 aa6.1□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W RIM20Q12033 661 aa6.1□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W RRP6Q12149 733 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W TRX2P22803 104 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W SED4P25365 1065 aa6.09□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W YKU70P32807 602 aa6.09□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W MFT1P33441 392 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W AAP1P37898 856 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W ETP1P38748 585 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W MIP6P38760 659 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W SAK1P38990 1142 aa6.09□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W PZF1P39933 429 aa6.09□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W RSC8P43609 557 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W ORC4P54791 529 aa6.09□□□□□ -1.43
VHS1YDR247W WHI4Q07655 649 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
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