RNA–Protein interactions for RNA: YDL137W

ARF2, Transcript of ADP-ribosylation factor, yeast

Gene ARF2, Length 546 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ARF2	YDL137W	OPT1	P40897	799 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	SMC3	P47037	1230 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	TAD1	P53065	400 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
ARF2	YDL137W	ESC8	Q08119	714 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	REC8	Q12188	680 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	ECM3	Q99252	613 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	GAL10	P04397	699 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	TUP1	P16649	713 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	DAL2	P25335	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	KIP1	P28742	1111 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	PEX2	P32800	271 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	JNM1	P36224	373 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	AGP2	P38090	596 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	EFM2	P38347	419 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	YHR202W	P38887	602 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	ALT1	P52893	592 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	MET13	P53128	600 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	HMI1	Q12039	706 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	CTF3	Q12748	733 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	MCM1	P11746	286 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	SPO12	P17123	173 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	CDC42	P19073	191 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	VPS3	P23643	1011 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	URK1	P27515	501 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	BIO2	P32451	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	GCS1	P35197	352 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	APM2	P38700	605 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	FMP10	P40098	244 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	YIR016W	P40572	265 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	MMM1	P41800	426 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	DAS1	P47005	663 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	YJR054W	P47114	497 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	STP1	Q00947	519 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	EAR1	Q03212	550 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	HEH2	Q03281	663 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	TFB3	Q03290	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	PPM1	Q04081	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	ATG9	Q12142	997 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	GAL80	P04387	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	SWI5	P08153	709 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	MTF2	P10849	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	PEX1	P24004	1043 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	RRN6	P32786	894 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	GYP6	P32806	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	MRPL7	P36519	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	DYS1	P38791	387 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	GEM1	P39722	662 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	BUD16	P39988	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	SDS3	P40505	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	ZAP1	P47043	880 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	INP52	P50942	1183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
ARF2	YDL137W	ERG5	P54781	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	SDH5	Q08230	162 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	GIS3	Q12418	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	STB3	Q12427	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	YPR117W	Q06116	2489 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	CHS1	P08004	1131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	MAS1	P10507	462 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	KAR3	P17119	729 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	VBA3	P25594	458 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	CSG2	P35206	410 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	YKL050C	P35736	922 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ARF2	YDL137W	VBA5	P36172	582 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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