RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Herc3-201ENSMUST00000031823 Large2Q5XPT3 690 aa13.89□□□□□ -0.19
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Herc3-201ENSMUST00000031823 Col11a2Q64739 1736 aa13.88□□□□□ -0.19
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