Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43,13■■■■■ 4,49
Rps6kb1Q8BSK8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,66■■■■■ 4,1
Rps6kb1Q8BSK8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39,55■■■■□ 3,92
Rps6kb1Q8BSK8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,51■■■■□ 3,92
Rps6kb1Q8BSK8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,26■■■■□ 3,88
Rps6kb1Q8BSK8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,05■■■■□ 3,84
Rps6kb1Q8BSK8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38,33■■■■□ 3,73
Rps6kb1Q8BSK8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37,82■■■■□ 3,64
Rps6kb1Q8BSK8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,77■■■■□ 3,64
Rps6kb1Q8BSK8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37,64■■■■□ 3,62
Rps6kb1Q8BSK8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,13■■■■□ 3,53
Rps6kb1Q8BSK8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37,11■■■■□ 3,53
Rps6kb1Q8BSK8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37■■■■□ 3,51
Rps6kb1Q8BSK8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,95■■■■□ 3,51
Rps6kb1Q8BSK8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,87■■■■□ 3,49
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,39■■■■□ 3,42
Rps6kb1Q8BSK8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Rps6kb1Q8BSK8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,33■■■■□ 3,41
Rps6kb1Q8BSK8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
Rps6kb1Q8BSK8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,25■■■■□ 3,39
Rps6kb1Q8BSK8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Rps6kb1Q8BSK8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Rps6kb1Q8BSK8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,22■■■■□ 3,39
Rps6kb1Q8BSK8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,21■■■■□ 3,39
Rps6kb1Q8BSK8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,07■■■■□ 3,37
Rps6kb1Q8BSK8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36,07■■■■□ 3,36
Rps6kb1Q8BSK8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36,03■■■■□ 3,36
Rps6kb1Q8BSK8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Rps6kb1Q8BSK8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Rps6kb1Q8BSK8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Rps6kb1Q8BSK8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
Rps6kb1Q8BSK8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,31
Rps6kb1Q8BSK8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,64■■■■□ 3,3
Rps6kb1Q8BSK8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,64■■■■□ 3,3
Rps6kb1Q8BSK8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35,62■■■■□ 3,29
Rps6kb1Q8BSK8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Rps6kb1Q8BSK8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35,23■■■■□ 3,23
Rps6kb1Q8BSK8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,22■■■■□ 3,23
Rps6kb1Q8BSK8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35,19■■■■□ 3,22
Rps6kb1Q8BSK8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Rps6kb1Q8BSK8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Rps6kb1Q8BSK8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,97■■■■□ 3,19
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Rps6kb1Q8BSK8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34,78■■■■□ 3,16
Rps6kb1Q8BSK8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Rps6kb1Q8BSK8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34,67■■■■□ 3,14
Rps6kb1Q8BSK8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Rps6kb1Q8BSK8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Rps6kb1Q8BSK8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34,48■■■■□ 3,11
Rps6kb1Q8BSK8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Rps6kb1Q8BSK8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Rps6kb1Q8BSK8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34,27■■■■□ 3,08
Rps6kb1Q8BSK8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Rps6kb1Q8BSK8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Rps6kb1Q8BSK8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Rps6kb1Q8BSK8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,04
Rps6kb1Q8BSK8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Rps6kb1Q8BSK8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Rps6kb1Q8BSK8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33,94■■■■□ 3,02
Rps6kb1Q8BSK8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Rps6kb1Q8BSK8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Rps6kb1Q8BSK8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,85■■■■□ 3,01
Rps6kb1Q8BSK8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33,84■■■■□ 3,01
Rps6kb1Q8BSK8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33,83■■■■□ 3,01
Rps6kb1Q8BSK8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Rps6kb1Q8BSK8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33,8■■■■□ 3
Rps6kb1Q8BSK8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,79■■■■□ 3
Rps6kb1Q8BSK8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33,73■■■□□ 2,99
Rps6kb1Q8BSK8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33,72■■■□□ 2,99
Rps6kb1Q8BSK8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33,69■■■□□ 2,98
Rps6kb1Q8BSK8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33,67■■■□□ 2,98
Rps6kb1Q8BSK8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Rps6kb1Q8BSK8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Rps6kb1Q8BSK8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Rps6kb1Q8BSK8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Rps6kb1Q8BSK8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33,44■■■□□ 2,94
Rps6kb1Q8BSK8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Rps6kb1Q8BSK8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,33■■■□□ 2,93
Rps6kb1Q8BSK8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Rps6kb1Q8BSK8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,27■■■□□ 2,92
Rps6kb1Q8BSK8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Rps6kb1Q8BSK8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Rps6kb1Q8BSK8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Rps6kb1Q8BSK8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Rps6kb1Q8BSK8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33,18■■■□□ 2,9
Rps6kb1Q8BSK8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Rps6kb1Q8BSK8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Rps6kb1Q8BSK8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Rps6kb1Q8BSK8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Rps6kb1Q8BSK8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33,02■■■□□ 2,88
Rps6kb1Q8BSK8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Rps6kb1Q8BSK8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Rps6kb1Q8BSK8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Rps6kb1Q8BSK8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,86
Rps6kb1Q8BSK8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32,94■■■□□ 2,86
Rps6kb1Q8BSK8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,89■■■□□ 2,86
Rps6kb1Q8BSK8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Rps6kb1Q8BSK8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32,88■■■□□ 2,85
Rps6kb1Q8BSK8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Rps6kb1Q8BSK8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms