Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.13■■■■■ 4.49
Rps6kb1Q8BSK8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Rps6kb1Q8BSK8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Rps6kb1Q8BSK8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Rps6kb1Q8BSK8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Rps6kb1Q8BSK8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Rps6kb1Q8BSK8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
Rps6kb1Q8BSK8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
Rps6kb1Q8BSK8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Rps6kb1Q8BSK8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Rps6kb1Q8BSK8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Rps6kb1Q8BSK8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
Rps6kb1Q8BSK8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Rps6kb1Q8BSK8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Rps6kb1Q8BSK8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rps6kb1Q8BSK8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rps6kb1Q8BSK8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rps6kb1Q8BSK8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rps6kb1Q8BSK8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Rps6kb1Q8BSK8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rps6kb1Q8BSK8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rps6kb1Q8BSK8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rps6kb1Q8BSK8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rps6kb1Q8BSK8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Rps6kb1Q8BSK8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Rps6kb1Q8BSK8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Rps6kb1Q8BSK8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rps6kb1Q8BSK8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rps6kb1Q8BSK8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rps6kb1Q8BSK8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Rps6kb1Q8BSK8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Rps6kb1Q8BSK8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Rps6kb1Q8BSK8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Rps6kb1Q8BSK8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Rps6kb1Q8BSK8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Rps6kb1Q8BSK8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Rps6kb1Q8BSK8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Rps6kb1Q8BSK8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Rps6kb1Q8BSK8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Rps6kb1Q8BSK8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Rps6kb1Q8BSK8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rps6kb1Q8BSK8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rps6kb1Q8BSK8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rps6kb1Q8BSK8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Rps6kb1Q8BSK8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rps6kb1Q8BSK8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rps6kb1Q8BSK8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rps6kb1Q8BSK8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rps6kb1Q8BSK8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rps6kb1Q8BSK8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rps6kb1Q8BSK8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rps6kb1Q8BSK8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rps6kb1Q8BSK8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rps6kb1Q8BSK8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Rps6kb1Q8BSK8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rps6kb1Q8BSK8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rps6kb1Q8BSK8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Rps6kb1Q8BSK8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rps6kb1Q8BSK8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rps6kb1Q8BSK8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rps6kb1Q8BSK8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Rps6kb1Q8BSK8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Rps6kb1Q8BSK8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rps6kb1Q8BSK8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Rps6kb1Q8BSK8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Rps6kb1Q8BSK8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Rps6kb1Q8BSK8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rps6kb1Q8BSK8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rps6kb1Q8BSK8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Rps6kb1Q8BSK8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rps6kb1Q8BSK8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Rps6kb1Q8BSK8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rps6kb1Q8BSK8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Rps6kb1Q8BSK8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rps6kb1Q8BSK8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rps6kb1Q8BSK8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rps6kb1Q8BSK8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rps6kb1Q8BSK8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rps6kb1Q8BSK8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rps6kb1Q8BSK8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rps6kb1Q8BSK8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rps6kb1Q8BSK8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rps6kb1Q8BSK8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rps6kb1Q8BSK8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rps6kb1Q8BSK8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rps6kb1Q8BSK8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rps6kb1Q8BSK8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rps6kb1Q8BSK8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rps6kb1Q8BSK8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rps6kb1Q8BSK8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Rps6kb1Q8BSK8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rps6kb1Q8BSK8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Rps6kb1Q8BSK8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rps6kb1Q8BSK8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rps6kb1Q8BSK8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rps6kb1Q8BSK8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rps6kb1Q8BSK8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rps6kb1Q8BSK8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.2 ms