RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528478.1

SBF2-208, Transcript of SET binding factor 2, human

TSL 4

Gene SBF2, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SBF2-208	ENST00000528478	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	ABCB9	Q9NP78	766 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	DEPP	Q9NTK1	212 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	EXD2	Q9NVH0	621 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF222	Q9UK12	451 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	POLQ	O75417	2590 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	HIVEP1	P15822	2718 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	ZFHX3	Q15911	3703 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	CACNA1C	Q13936	2221 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	MED13L	Q71F56	2210 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	TACC2	O95359	2948 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478		A0A0U1RRA0	63 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	IRGM	A1A4Y4	181 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	RAB19	A4D1S5	217 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	HMSD	A8MTL9	139 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	WWP2	O00308	870 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	PRKY	O43930	277 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	LDB3	O75112	727 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	OR2J2	O76002	312 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	SERPINA3	P01011	423 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	APOC3	P02656	99 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	RLN2	P04090	185 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	NMB	P08949	121 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	STAG3L3	P0CL85	134 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	SLC2A1	P11166	492 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	CD99	P14209	185 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	GP9	P14770	177 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF44	P15621	663 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	RAB3B	P20337	219 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	S1PR1	P21453	382 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	PRKACG	P22612	351 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	PAX6	P26367	422 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	CHRNB4	P30926	498 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	MNDA	P41218	407 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	CRYBB2	P43320	205 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	SLC6A8	P48029	635 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	RGS4	P49798	205 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	DLX5	P56178	289 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	TAS2R39	P59534	338 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	TAS2R60	P59551	318 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	RAB5B	P61020	215 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	HOXC5	Q00444	222 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	REEP5	Q00765	189 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	DEFA6	Q01524	100 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	PLGLB1	Q02325	96 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	ST3GAL4	Q11206	333 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	SPIN4	Q56A73	249 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	XKR7	Q5GH72	579 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	AVPI1	Q5T686	147 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	ABHD13	Q7L211	337 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	SVBP	Q8N300	66 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SBF2-208	ENST00000528478	TMEM99	Q8N816	258 aa		3.57	□□□□□ -1.84

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