RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C NMD2P38798 1089 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C SFB3P38810 929 aa2.52□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C ATG4P53867 494 aa2.52□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C APM1Q00776 475 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C REC102Q02721 264 aa2.52□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C UGO1Q03327 502 aa2.52□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C NHX1Q04121 633 aa2.52□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C COG8Q04632 607 aa2.52□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C AFT2Q08957 416 aa2.52□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C RPN13O13563 156 aa2.51□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C PHO8P11491 566 aa2.51□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C RNR1P21524 888 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C VBA3P25594 458 aa2.51□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C YPT7P32939 208 aa2.51□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C HSL7P38274 827 aa2.51□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C RPN10P38886 268 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C BDH2P39713 417 aa2.51□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C ARG2P40360 574 aa2.51□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C YFL052WP43551 465 aa2.51□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C NOP9P47077 666 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C PCL10P53124 433 aa2.51□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C NPY1P53164 384 aa2.51□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C LEE1Q02799 301 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C YLR125WQ12138 136 aa2.51□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C ICT1Q12385 394 aa2.51□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C THR1P17423 357 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C GSY1P23337 708 aa2.5□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C PCL2P25693 308 aa2.5□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C MVD1P32377 396 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C RRP14P36080 434 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C APT2P36973 181 aa2.5□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C CRP1P38845 465 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C YEL020CP39994 560 aa2.5□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C ALG12P53730 551 aa2.5□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C RPN7Q06103 429 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C THI22Q06490 572 aa2.5□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C MDM10P18409 493 aa2.5□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C THI4P32318 326 aa2.5□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C GLG1P36143 616 aa2.5□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C CTR1P49573 406 aa2.5□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C BRE5P53741 515 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C CLF1Q12309 687 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C CCR4P31384 837 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C PEX6P33760 1030 aa2.49□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C SSZ1P38788 538 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C PAC2P39937 518 aa2.49□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C ATG33Q06485 197 aa2.49□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C ZRT2Q12436 422 aa2.49□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C SET3P36124 751 aa2.49□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C PCM1P38628 557 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C YJR039WP47107 1121 aa2.49□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C MRK1P50873 501 aa2.49□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C THI7Q05998 598 aa2.49□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C YLR001CQ07895 862 aa2.49□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C DCS2Q12123 353 aa2.49□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C RAD18P10862 487 aa2.48□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C HMG1P12683 1054 aa2.48□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C SPO11P23179 398 aa2.48□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C PRP28P23394 588 aa2.48□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C BCS1P32839 456 aa2.48□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C MNN4P36044 1178 aa2.48□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C AKL1P38080 1108 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C BIT2P38346 545 aa2.48□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C DSS1P39112 969 aa2.48□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C RSC8P43609 557 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C SET2P46995 733 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C UBC9P50623 157 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C POB3Q04636 552 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C FUB1P25659 250 aa2.47□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C MSS1P32559 526 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C TMT1P32643 299 aa2.47□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C BRN1P38170 754 aa2.47□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C MRI1Q06489 411 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C NTG2Q08214 380 aa2.47□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C APN2P38207 520 aa2.47□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C BEM4P39011 633 aa2.47□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C YNL195CP40168 261 aa2.47□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C YAP7Q08182 245 aa2.47□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C USV1Q12132 391 aa2.47□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C ECM3Q99252 613 aa2.47□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C SFL1P20134 766 aa2.46□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C GMH1P36125 273 aa2.46□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C YMC2P38087 329 aa2.46□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C MUP3P38734 546 aa2.46□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C MNN1P39106 762 aa2.46□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C MIT1P40002 666 aa2.46□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C AIM14P53109 570 aa2.46□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C DOS2P54858 310 aa2.46□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C GIN4Q12263 1142 aa2.46□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C NUG1P40010 520 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C GLO1P50107 326 aa2.45□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C YGR151CP53287 111 aa2.45□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C SEC5P89102 971 aa2.45□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C CHS5Q12114 671 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C FEN2P25621 512 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C ORC2P32833 620 aa2.45□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C CTP1P38152 299 aa2.45□□□□□ -2.02
HDA3YPR179C FPR3P38911 411 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
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