RNA–Protein interactions for RNA: YKL209C

STE6, Transcript of Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene STE6, Length 3,873 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STE6	YKL209C	KEX2	P13134	814 aa		3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	ROG3	P43602	733 aa		3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	NNF1	P47149	201 aa		3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	MSF1	P08425	469 aa		3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	RRT12	P25381	491 aa		3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	ATG12	P38316	186 aa		3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	NUP82	P40368	713 aa		3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	OSW7	P43611	510 aa		3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	HFM1	P51979	1187 aa		3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	YLR287C	Q05881	355 aa		3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	ECM7	Q06200	448 aa		3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	ALG1	P16661	449 aa		3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	KAR3	P17119	729 aa		3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	GLN3	P18494	730 aa		3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	MAL33	P38157	468 aa		3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	YGR130C	P53278	816 aa		3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	COQ6	P53318	479 aa		3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	FAR11	P53917	953 aa		3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	PMT7	Q06644	662 aa		3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	YPR084W	Q06821	456 aa		3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	SGO1	Q08490	590 aa		3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	EMP46	Q12396	444 aa		3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	CTF3	Q12748	733 aa		3.36	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	MRPL40	P36534	297 aa		3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	AGP2	P38090	596 aa		3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	NPP2	P39997	493 aa		3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	ARA2	Q04212	335 aa		3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	SIL1	Q08199	421 aa		3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	DCS2	Q12123	353 aa		3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	PTC5	Q12511	572 aa		3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	BRF1	P29056	596 aa		3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	YER186C	P40101	306 aa		3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	YGL140C	P53120	1219 aa		3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	PML39	Q03760	334 aa		3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	NBP2	Q12163	236 aa		3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	HSP78	P33416	811 aa		3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	STE13	P33894	931 aa		3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	YHR054C	P38780	354 aa		3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	YHR078W	P38799	552 aa		3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	SDS3	P40505	327 aa		3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	CDC1	P40986	491 aa		3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	POL31	P46957	487 aa		3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	ADA2	Q02336	434 aa		3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	HER2	Q03557	464 aa		3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	MPC54	Q08550	464 aa		3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	AFT2	Q08957	416 aa		3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	SLX4	Q12098	748 aa		3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	MPD2	Q99316	277 aa		3.35	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.34	□□□□□ -1.87	RIP-Chip
STE6	YKL209C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	SNF5	P18480	905 aa		3.34	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	SPO11	P23179	398 aa		3.34	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	HMT1	P38074	348 aa		3.34	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	SMF1	P38925	575 aa		3.34	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	LSB6	P42951	607 aa		3.34	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	BFA1	P47113	574 aa		3.34	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	ATH1	P48016	1211 aa		3.34	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	REG1	Q00816	1014 aa		3.34	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	OPY2	Q06810	360 aa		3.34	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	IRA2	P19158	3079 aa		3.34	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	SEM1	O94742	89 aa		3.34	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	YER152C	P10356	443 aa		3.34	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	MTF2	P10849	440 aa		3.34	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	NEM1	P38757	446 aa		3.34	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	ULI1	P43604	169 aa		3.34	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	ARO80	Q04052	950 aa		3.34	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	TMN2	Q04562	672 aa		3.34	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	YCS4	Q06156	1176 aa		3.34	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	YPR027C	Q12079	277 aa		3.34	□□□□□ -1.87
STE6	YKL209C	MCM2	P29469	868 aa		3.34	□□□□□ -1.88
STE6	YKL209C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
STE6	YKL209C	MSR1	P38714	643 aa		3.34	□□□□□ -1.88
STE6	YKL209C	OSW5	P40219	148 aa		3.34	□□□□□ -1.88
STE6	YKL209C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
STE6	YKL209C	PEX13	P80667	386 aa		3.34	□□□□□ -1.88
STE6	YKL209C	APC11	Q12157	165 aa		3.34	□□□□□ -1.88
STE6	YKL209C	FOB1	O13329	566 aa		3.33	□□□□□ -1.88
STE6	YKL209C	COX3	P00420	269 aa		3.33	□□□□□ -1.88
STE6	YKL209C	IME1	P21190	360 aa		3.33	□□□□□ -1.88

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