RNA–Protein interactions for RNA: YKL157W

APE2, Transcript of Aminopeptidase yscII, yeast

Gene APE2, Length 2,859 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APE2	YKL157W	GTT3	P39996	337 aa		3.85	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	UFO1	Q04511	668 aa		3.85	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	PHM6	Q05637	104 aa		3.85	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	MET7	Q08645	548 aa		3.85	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	TAF3	Q12297	353 aa		3.85	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	JIP3	O13555	125 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	EXO70	P19658	623 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	AFG2	P32794	780 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	COY1	P34237	679 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	SRL3	P36167	246 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.84	□□□□□ -1.79	not detected
APE2	YKL157W	UBP13	P38187	747 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	POP4	P38336	279 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	SAE2	P46946	345 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	FMS1	P50264	508 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	ZIP2	P53061	704 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	ERP6	P53198	216 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	YMR027W	Q04371	470 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	GPM3	Q12326	303 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	RAD10	P06838	210 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	CHS2	P14180	963 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	REC107	P21651	314 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	SPS22	P25380	463 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	KAR4	P25583	335 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	MET4	P32389	672 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	PCA1	P38360	1216 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	NUP60	P39705	539 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	ALG5	P40350	334 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	JEM1	P40358	645 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	PRK1	P40494	810 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	AIM21	P40563	679 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	TAF1	P46677	1066 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	MIG2	P53035	382 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	MTC3	P53077	123 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	NUT1	P53114	1132 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	DIP5	P53388	608 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	HST2	P53686	357 aa		3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
APE2	YKL157W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	CDC42	P19073	191 aa		3.84	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	MRPL25	P23369	157 aa		3.84	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	GPI10	P30777	616 aa		3.84	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	BCK2	P33306	851 aa		3.84	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	CSE1	P33307	960 aa		3.84	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	DUG2	P38149	878 aa		3.84	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	ERP5	P38819	212 aa		3.84	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	PET100	P38958	111 aa		3.84	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	NPP2	P39997	493 aa		3.84	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	ARG2	P40360	574 aa		3.84	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	YJL107C	P42947	387 aa		3.84	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	DAS1	P47005	663 aa		3.84	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	CLA4	P48562	842 aa		3.84	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	YNL144C	P53907	740 aa		3.84	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	OSH6	Q02201	448 aa		3.84	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	OXR1	Q08952	273 aa		3.84	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	SLX4	Q12098	748 aa		3.84	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	GIS3	Q12418	502 aa		3.84	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	BI2	P03873	423 aa		3.83	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	BI4	P03879	638 aa		3.83	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	MLS1	P30952	554 aa		3.83	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	TMT1	P32643	299 aa		3.83	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	MRE11	P32829	692 aa		3.83	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	PTH2	P34222	208 aa		3.83	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	CCL1	P37366	393 aa		3.83	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.83	□□□□□ -1.8	not detected
APE2	YKL157W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	YJL045W	P47052	634 aa		3.83	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	NMA2	P53204	395 aa		3.83	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	TAM41	P53230	385 aa		3.83	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	YNL058C	P53947	316 aa		3.83	□□□□□ -1.8
APE2	YKL157W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8

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