RNA–Protein interactions for RNA: YJL173C

RFA3, Transcript of Subunit of heterotrimeric Replication Protein A (RPA), yeast

Gene RFA3, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RFA3	YJL173C	YAP1802	P53309	568 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RFA3	YJL173C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RFA3	YJL173C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RFA3	YJL173C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RFA3	YJL173C	DCS2	Q12123	353 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RFA3	YJL173C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RFA3	YJL173C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RFA3	YJL173C	NUP145	P49687	1317 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFA3	YJL173C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
RFA3	YJL173C	HIR1	P32479	840 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFA3	YJL173C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RFA3	YJL173C	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RFA3	YJL173C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RFA3	YJL173C	YHR202W	P38887	602 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFA3	YJL173C	LYS9	P38999	446 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFA3	YJL173C	GID8	P40208	455 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFA3	YJL173C	DOS2	P54858	310 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFA3	YJL173C	SSL2	Q00578	843 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFA3	YJL173C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RFA3	YJL173C	TMN2	Q04562	672 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFA3	YJL173C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RFA3	YJL173C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RFA3	YJL173C	SPC42	P36094	363 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFA3	YJL173C	SFB3	P38810	929 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFA3	YJL173C	RET2	P43621	546 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFA3	YJL173C	YJR096W	P47137	282 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFA3	YJL173C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RFA3	YJL173C	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RFA3	YJL173C	UME1	Q03010	460 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFA3	YJL173C	ECM3	Q99252	613 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFA3	YJL173C	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	GET2	P40056	285 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	SDS3	P40505	327 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	STU2	P46675	888 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	YGR153W	P48238	217 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	GND2	P53319	492 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	PEX1	P24004	1043 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	MTH1	P35198	433 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	YNL195C	P40168	261 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	SIR3	P06701	978 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	YGR237C	P50089	785 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	YMR210W	Q03649	449 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	IRC10	Q08118	586 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	VHS3	Q08438	674 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	CDC43	P18898	376 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	SEC15	P22224	910 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	PHO11	P35842	467 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	PHO12	P38693	467 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
RFA3	YJL173C	HFD1	Q04458	532 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	KIN3	P22209	435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	PET127	P32606	800 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	BEM4	P39011	633 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	YGL081W	P53156	320 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	YLR407W	Q06070	228 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	THI22	Q06490	572 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	PIG2	P40187	538 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	ARG2	P40360	574 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	NDC80	P40460	691 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	FHN1	P53279	174 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	POM34	Q12445	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFA3	YJL173C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	KIN82	P25341	720 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	YKU70	P32807	602 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	BIT2	P38346	545 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	CTR1	P49573	406 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	VPS36	Q06696	566 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	USV1	Q12132	391 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	PRP28	P23394	588 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	DMC1	P25453	334 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	BCS1	P32839	456 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	YJL206C	P39529	758 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	GPG1	P53130	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	ATG4	P53867	494 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	ECM9	Q02202	377 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	YHM2	Q04013	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	MLH3	Q12083	715 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	SWI6	P09959	803 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	ABF1	P14164	731 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFA3	YJL173C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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