RNA–Protein interactions for RNA: YFR056C

YFR056C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YFR056C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YFR056CYFR056C SIR3P06701 978 aa3□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C GSY1P23337 708 aa3□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C CCR4P31384 837 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C MTC2P34246 357 aa3□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C MCD4P36051 919 aa3□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C UBP12P39538 1254 aa3□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C YGL081WP53156 320 aa3□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C DNM1P54861 757 aa3□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C ARG5,6Q01217 863 aa3□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C TAF3Q12297 353 aa3□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C YLR149CQ99296 730 aa3□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C MSH2P25847 964 aa2.99□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C SFP1P32432 683 aa2.99□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C PHO11P35842 467 aa2.99□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C PHO12P38693 467 aa2.99□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C MIP6P38760 659 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C BDH2P39713 417 aa2.99□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C CCT7P42943 550 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C UBC9P50623 157 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C REC102Q02721 264 aa2.99□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C HOF1Q05080 669 aa2.99□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C RPN7Q06103 429 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C CLF1Q12309 687 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C Q0142Q9ZZW4 58 aa2.99□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C TOP1P04786 769 aa2.98□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C RPL8AP17076 256 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C FLO10P36170 1169 aa2.98□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C HSL7P38274 827 aa2.98□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C LYS9P38999 446 aa2.98□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C DSS1P39112 969 aa2.98□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C YEL020CP39994 560 aa2.98□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C NUG1P40010 520 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C DOT6P40059 670 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C CAF16P43569 289 aa2.98□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C COX18P53239 316 aa2.98□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C ATG4P53867 494 aa2.98□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C TFB2Q02939 513 aa2.98□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C NHX1Q04121 633 aa2.98□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C YOL057WQ08225 711 aa2.98□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C ZRT2Q12436 422 aa2.98□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C NUP145P49687 1317 aa2.97□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C CDC9P04819 755 aa2.97□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C MDM10P18409 493 aa2.97□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C MEF1P25039 761 aa2.97□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C VBA3P25594 458 aa2.97□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data2.97□□□□□ -1.93not detected
YFR056CYFR056C FHN1P53279 174 aa2.97□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C YNR029CP53729 429 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C THI7Q05998 598 aa2.97□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C AFT2Q08957 416 aa2.97□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C MDM12Q92328 271 aa2.97□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C HRP1Q99383 534 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
YFR056CYFR056C ABF1P14164 731 aa2.96□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C RNR1P21524 888 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C ERG6P25087 383 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C EMP70P32802 667 aa2.96□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C ORC2P32833 620 aa2.96□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C YKR051WP36142 418 aa2.96□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C GRX7P38068 203 aa2.96□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C HLJ1P48353 224 aa2.96□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C UGO1Q03327 502 aa2.96□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C MLH3Q12083 715 aa2.96□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C USV1Q12132 391 aa2.96□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C PEX1P24004 1043 aa2.95□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C HOG1P32485 435 aa2.95□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C PEX6P33760 1030 aa2.95□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C YKR018CP36114 725 aa2.95□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C GMH1P36125 273 aa2.95□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C GET2P40056 285 aa2.95□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C YGR237CP50089 785 aa2.95□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C PCL10P53124 433 aa2.95□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C SLK19Q08581 821 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C HOM2P13663 365 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C THR1P17423 357 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data2.94□□□□□ -1.94not detected
YFR056CYFR056C KCC4P25389 1037 aa2.94□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C FUB1P25659 250 aa2.94□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C APN2P38207 520 aa2.94□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C PIG2P40187 538 aa2.94□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C SDA1P53313 767 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C SPC98P53540 846 aa2.94□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C FOL1P53848 824 aa2.94□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C MRI1Q06489 411 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C ECM3Q99252 613 aa2.94□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C SRD1P09007 221 aa2.93□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C RPA135P22138 1203 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C PRP28P23394 588 aa2.93□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C UBS1P38290 277 aa2.93□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C PAC2P39937 518 aa2.93□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C TPM2P40414 161 aa2.93□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C NOP9P47077 666 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C YJR120WP47157 116 aa2.93□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C YNL193WP53870 558 aa2.93□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C UME1Q03010 460 aa2.93□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C THI73Q07904 523 aa2.93□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C TMA17Q12513 150 aa2.93□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C RAD18P10862 487 aa2.92□□□□□ -1.94
YFR056CYFR056C SEC15P22224 910 aa2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14 ms