RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC17A1Q14916 467 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BCL2A1Q16548 175 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KCNMB1Q16558 191 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CR1LQ2VPA4 569 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C22orf42Q6IC83 251 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CREB3L2Q70SY1 520 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF610Q8N9Z0 462 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NOXO1Q8NFA2 376 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR6N2Q8NGY6 317 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR2V1Q8NHB1 315 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MCFD2Q8NI22 146 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PHYHIPQ92561 330 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HTRA1Q92743 480 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GHSRQ92847 366 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC25A46Q96AG3 418 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SFXN2Q96NB2 322 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RBP7Q96R05 134 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BARHL1Q9BZE3 327 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KCNN2Q9H2S1 579 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLGRKTQ9HBL7 147 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PALMDQ9NP74 551 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ACOXLQ9NUZ1 547 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CLCF1Q9UBD9 225 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KCNG2Q9UJ96 466 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LAMP5Q9UJQ1 280 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM157AC9JC47 383 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CLDN25C9JDP6 229 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GATBO75879 557 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SERPINA3P01011 423 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CD8AP01732 235 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KRT8P05787 483 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PSKH1P11801 424 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NR2C1P13056 603 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CPN1P15169 458 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SRP14P37108 136 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OPRL1P41146 370 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ETV6P41212 452 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MTNR1BP49286 362 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CLDN15P56746 228 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CLDN20P56880 219 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CARD18P57730 90 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC18B1Q6NT16 456 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DEGS2Q6QHC5 323 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARL9Q6T311 187 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DPY19L4Q7Z388 723 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM220AQ7Z4H9 259 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CROCCP3Q8IVE0 287 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GLB1L2Q8IW92 636 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MFSD4AQ8N468 514 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF525Q8N782 197 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZIC4Q8N9L1 334 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SYT14Q8NB59 555 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR9K2Q8NGE7 335 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ABHD4Q8TB40 342 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BORCS5Q969J3 196 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM54Q969K7 222 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR8B4Q96RC9 309 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMED9Q9BVK6 235 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HDHD5Q9BXW7 423 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SRXN1Q9BYN0 137 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HMG20AQ9NP66 347 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GNG8Q9UK08 70 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PEX16Q9Y5Y5 336 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ALPK2Q86TB3 2170 aa8.28□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa8.27□□□□□ -1.09
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa8.27□□□□□ -1.09
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF726A6NNF4 738 aa8.27□□□□□ -1.09
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF716A6NP11 495 aa8.27□□□□□ -1.09
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TNFSF11O14788 317 aa8.27□□□□□ -1.09
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF254O75437 659 aa8.27□□□□□ -1.09
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF432O94892 652 aa8.27□□□□□ -1.09
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CDRT1O95170 752 aa8.27□□□□□ -1.09
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GPANK1O95872 356 aa8.27□□□□□ -1.09
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TGFAP01135 160 aa8.27□□□□□ -1.09
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC25A16P16260 332 aa8.27□□□□□ -1.09
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ENPP1P22413 925 aa8.27□□□□□ -1.09
SOX9-AS1-201ENST00000412640 USF1P22415 310 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CFL1P23528 166 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EDNRAP25101 427 aa8.27□□□□□ -1.09
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LAP3P28838 519 aa8.27□□□□□ -1.09
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DCTDP32321 178 aa8.27□□□□□ -1.09
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SDC2P34741 201 aa8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms