RNA–Protein interactions for RNA: YML043C

RRN11, Transcript of Component of the core factor (CF) rDNA transcription factor complex, yeast

Gene RRN11, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN11	YML043C	FLP1	P03870	423 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	CDC34	P14682	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	IME1	P21190	360 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	OCA4	P25366	362 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	NPL6	P32832	435 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	ATO2	P32907	282 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	SLA2	P33338	968 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	YSW1	P38280	609 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	IFA38	P38286	347 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	YIL001W	P40560	513 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	IES1	P43579	692 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	MET12	P46151	657 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	SRB7	P47822	140 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	YKR005C	Q02203	525 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	ULP1	Q02724	621 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	DCS1	Q06151	350 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	MCP2	Q06567	569 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	VPS15	P22219	1454 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	CYB2	P00175	591 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	YML002W	P0CF17	737 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
RRN11	YML043C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	MGM1	P32266	881 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	PTR2	P32901	601 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	YBR287W	P38355	427 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	TAT2	P38967	592 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	ESL1	P40456	1118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	CTH1	P47976	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	HOP2	P53187	214 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	SFB2	P53953	876 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	YPL109C	Q02981	657 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	PHM6	Q05637	104 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	ENT2	Q05785	613 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	RTT10	Q08924	1013 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	YPL277C	Q08989	487 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	TAF3	Q12297	353 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	OSH2	Q12451	1283 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	YOR1	P53049	1477 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	REP1	P03871	373 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	FUS1	P11710	512 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	APN1	P22936	367 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	MRPL25	P23369	157 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	KAP122	P32767	1081 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	OCT1	P35999	772 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	YRO2	P38079	344 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	MAL31	P38156	614 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	YHL012W	P38709	493 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	YIL092W	P40497	633 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	URB2	P47108	1174 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	SSN8	P47821	323 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	MON1	P53129	644 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	RCM1	P53972	490 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	YDL121C	Q07541	149 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	YOR223W	Q12015	292 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	ACF2	Q12168	779 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	ULS1	Q08562	1619 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	BIK1	P11709	440 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	TSR4	P25040	408 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	DPB3	P27344	201 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	VPH2	P32341	215 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	NFU1	P32860	256 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	SSO1	P32867	290 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	TFC4	P33339	1025 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	SEG2	P34250	1132 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	MAC1	P35192	417 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	MIA40	P36046	403 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRN11	YML043C	FZO1	P38297	855 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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