RNA–Protein interactions for RNA: YKL062W

MSN4, Transcript of Stress-responsive transcriptional activator, yeast

Gene MSN4, Length 1,893 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSN4	YKL062W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	TMA10	Q06177	86 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	UPC2	Q12151	913 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	FBP1	P09201	348 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	DAL7	P21826	554 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	RAD53	P22216	821 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	STE11	P23561	717 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	TAF1	P46677	1066 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	BNA1	P47096	177 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	PMT3	P47190	753 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	CYB2	P00175	591 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	SED4	P25365	1065 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	EUG1	P32474	517 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	SPC29	P33419	253 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	RSC1	P53236	928 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	PKH1	Q03407	766 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	PSR1	Q07800	427 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	THI73	Q07904	523 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	GAL1	P04385	528 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	PLC1	P32383	869 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	SRB7	P47822	140 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	MAL11	P53048	616 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	TAD1	P53065	400 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	PEX14	P53112	341 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	CTF4	Q01454	927 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	MET14	Q02196	202 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	UME1	Q03010	460 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	NPC2	Q12408	173 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	NUP145	P49687	1317 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	MEP1	P40260	492 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	PUS2	P53167	370 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	ATP25	Q03153	612 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	REH1	Q06709	432 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	MET7	Q08645	548 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	YCR015C	P25616	317 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	STE14	P32584	239 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	RKM3	P38222	552 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	GIP4	P39732	760 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	SDP1	P40479	209 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	GPI8	P49018	411 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	UBA2	P52488	636 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	YNL193W	P53870	558 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	YML131W	Q03102	365 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MSN4	YKL062W	YCL002C	P25565	263 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	RRN3	P36070	627 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	ESL1	P40456	1118 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	HOL1	P53389	586 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	UGO1	Q03327	502 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	PHM6	Q05637	104 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	CTS1	P29029	562 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	TFC4	P33339	1025 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	SAP190	P36123	1033 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	APE4	P38821	490 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	MNT3	P40549	630 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	EXG2	P52911	562 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	MDM12	Q92328	271 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	PRC1	P00729	532 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	BRF1	P29056	596 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	DCG1	P32460	244 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	CTF8	P38877	133 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	RSC3	Q06639	885 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	GUP2	Q08929	609 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	KAR4	P25583	335 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	PER1	P25625	357 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	MCM10	P32354	571 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	PTH2	P34222	208 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	PTP2	P29461	750 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	DBF20	P32328	564 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	ANP1	P32629	500 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	YHR078W	P38799	552 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	VTC2	P43585	828 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	YGR016W	P53209	190 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	PSR2	Q07949	397 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MSN4	YKL062W	SSP2	Q08646	371 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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