RNA–Protein interactions for RNA: YJR087W

YJR087W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJR087W, Length 351 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJR087W	YJR087W	TGL5	Q12043	749 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YJR087W	YJR087W	HSL7	P38274	827 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YJR087W	YJR087W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.29	□□□□□ -1.72
YJR087W	YJR087W	RIA1	P53893	1110 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YJR087W	YJR087W	NHX1	Q04121	633 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YJR087W	YJR087W	TMN2	Q04562	672 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YJR087W	YJR087W	ASM4	Q05166	528 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YJR087W	YJR087W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
YJR087W	YJR087W	HOG1	P32485	435 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YJR087W	YJR087W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
YJR087W	YJR087W	APT2	P36973	181 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YJR087W	YJR087W	MUK1	Q02866	612 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YJR087W	YJR087W	COG8	Q04632	607 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YJR087W	YJR087W	SRD1	P09007	221 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	MEF1	P25039	761 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	YEL1	P34225	687 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	IRC13	Q08630	104 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	REV7	P38927	245 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	FMP52	P40008	231 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	HOS4	P40480	1083 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	BAP3	P41815	604 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	IRC10	Q08118	586 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	SGO1	Q08490	590 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	SPC42	P36094	363 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	BCD1	P38772	366 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	PCL5	P38794	229 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	SDS3	P40505	327 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	UBC11	P52492	156 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	YAP1802	P53309	568 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	GND2	P53319	492 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	SSL2	Q00578	843 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	GIS1	Q03833	894 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	MCM21	Q06675	368 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	RAD18	P10862	487 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	MTH1	P35198	433 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	YKR018C	P36114	725 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	YKR051W	P36142	418 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	YHR112C	P38716	378 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	REC102	Q02721	264 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	NTG2	Q08214	380 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	CDC43	P18898	376 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	PPG1	P32838	368 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	TEL2	P53038	688 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	PCL10	P53124	433 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	PCL2	P25693	308 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	RNH70	P53331	553 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	ATG33	Q06485	197 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	GIN4	Q12263	1142 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YJR087W	YJR087W	SFL1	P20134	766 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	MIH1	P23748	554 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	HIR1	P32479	840 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	NUP60	P39705	539 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	MTL1	P53214	551 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	SIR3	P06701	978 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	KIN3	P22209	435 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	GID8	P40208	455 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	AIM14	P53109	570 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	ALG12	P53730	551 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	DMC1	P25453	334 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	SFP1	P32432	683 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	APN2	P38207	520 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	FMO1	P38866	432 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	TFB2	Q02939	513 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	HMG1	P12683	1054 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	SFB3	P38810	929 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	LYS9	P38999	446 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	COX18	P53239	316 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	YNL193W	P53870	558 aa		4.18	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20 ms