RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HCA4	YJL033W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	DAL7	P21826	554 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	YAP3	P38749	330 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	PUS2	P53167	370 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	NPC2	Q12408	173 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	MMS1	Q06211	1407 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	PPG1	P32838	368 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	MAL11	P53048	616 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	RNH70	P53331	553 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	MET7	Q08645	548 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	RAD9	P14737	1309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	VMR1	P38735	1592 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	SPE2	P21182	396 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	SDP1	P40479	209 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	TAD1	P53065	400 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	GUP2	Q08929	609 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	MDM12	Q92328	271 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	YOR093C	Q12275	1648 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	MSH2	P25847	964 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	STE14	P32584	239 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	CTF8	P38877	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	GSY1	P23337	708 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	YCR015C	P25616	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	CTS1	P29029	562 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	SAP190	P36123	1033 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	GIP4	P39732	760 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	DJP1	P40564	432 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	TAF1	P46677	1066 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	EXG2	P52911	562 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	UGO1	Q03327	502 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	RAV1	P47104	1357 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	DCG1	P32460	244 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	PRC1	P00729	532 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	YKL222C	P35995	705 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	ALG12	P53730	551 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	RSC3	Q06639	885 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	ENB1	Q08299	606 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	MET5	P47169	1442 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	YCL002C	P25565	263 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	ESL2	P36168	1195 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	YHR078W	P38799	552 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	RAD26	P40352	1085 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HCA4	YJL033W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	PEX6	P33760	1030 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	MTC2	P34246	357 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	DSS1	P39112	969 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	SHR5	P41912	237 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	YDL144C	Q07589	356 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	KAR4	P25583	335 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	YIR014W	P40570	242 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	SWM1	Q12379	170 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	NUP192	P47054	1683 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	HCM1	P25364	564 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	PER1	P25625	357 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	THI21	Q08975	551 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	DOP1	Q03921	1698 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	IML1	P47170	1584 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	DIF1	O13577	133 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	VBA3	P25594	458 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	HXT16	P47185	567 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	CDC9	P04819	755 aa		4.5	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	CAF16	P43569	289 aa		4.5	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	ALY2	P47029	1046 aa		4.5	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	PEX19	Q07418	342 aa		4.5	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	DNF2	Q12675	1612 aa		4.5	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	PCT1	P13259	424 aa		4.5	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	SPC110	P32380	944 aa		4.5	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	PZF1	P39933	429 aa		4.5	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	NTG2	Q08214	380 aa		4.5	□□□□□ -1.69
HCA4	YJL033W	KRE5	P22023	1365 aa		4.5	□□□□□ -1.69

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