RNA–Protein interactions for RNA: YHL004W

MRP4, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRP4, Length 1,185 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRP4	YHL004W	OPI1	P21957	404 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRP4	YHL004W	CDC20	P26309	610 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRP4	YHL004W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRP4	YHL004W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRP4	YHL004W	YGR237C	P50089	785 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRP4	YHL004W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRP4	YHL004W	MDM1	Q01846	1127 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRP4	YHL004W	PKH1	Q03407	766 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRP4	YHL004W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
MRP4	YHL004W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRP4	YHL004W	SVS1	Q12254	260 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRP4	YHL004W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	APL1	P27351	700 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	YAP1801	P38856	637 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	CNN1	P43618	361 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	PMT3	P47190	753 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	TYW3	P53177	273 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	OPI10	Q08202	246 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	TMA17	Q12513	150 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	NCB2	Q92317	146 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	CDC6	P09119	513 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	SWC3	P31376	625 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	HIR1	P32479	840 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	DOM34	P33309	386 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	PTH2	P34222	208 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	GEM1	P39722	662 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	MPH1	P40562	993 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	ENT3	P47160	408 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	YGL082W	P53155	381 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	MEH1	Q02205	184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	RXT3	Q07458	294 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	GPB1	Q08886	897 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	CDC34	P14682	295 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	SSH4	P32343	579 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	LST4	P34239	828 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	UGA2	P38067	497 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	MXR1	P40029	184 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	HOS4	P40480	1083 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	SND1	Q04007	877 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	TMA10	Q06177	86 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	RAD50	P12753	1312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	BAS1	P22035	811 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	SWI3	P32591	825 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	RER2	P35196	286 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	MAL31	P38156	614 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	VID27	P40157	782 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	HUL4	P40985	892 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	GCV2	P49095	1034 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	NKP2	Q06162	153 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	NTG2	Q08214	380 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	PNS1	Q12412	539 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	CDC16	P09798	840 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	MSH2	P25847	964 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	YIR014W	P40570	242 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	UBX4	P54730	416 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	SAC3	P46674	1301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	PEA2	P40091	420 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	ERP6	P53198	216 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	TFB2	Q02939	513 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	YAP6	Q03935	383 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	SPC19	Q03954	165 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	PUS9	Q12069	462 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRP4	YHL004W	CIT1	P00890	479 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	CAN1	P04817	590 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	HCM1	P25364	564 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	ARE1	P25628	610 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	CDC11	P32458	415 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	NFU1	P32860	256 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	TRM2	P33753	639 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	MCM7	P38132	845 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	YJR120W	P47157	116 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRP4	YHL004W	SRB7	P47822	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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