RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W AIM26P32858 118 aa6.31□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W ECM21P38167 1117 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W SAF1P38352 637 aa6.31□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W YAP1801P38856 637 aa6.31□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W PEX7P39108 375 aa6.31□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W DOT6P40059 670 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W OYE3P41816 400 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W ALY2P47029 1046 aa6.31□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W AIM14P53109 570 aa6.31□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W COG6P53959 839 aa6.31□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W NHX1Q04121 633 aa6.31□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W NSI1Q12457 570 aa6.31□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W URA1P28272 314 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W COQ2P32378 372 aa6.31□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W SEC6P32844 805 aa6.31□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W TAT1P38085 619 aa6.31□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W RFC5P38251 354 aa6.31□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W XYL2Q07993 356 aa6.31□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W RPS9AO13516 197 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W SPS1P08458 490 aa6.3□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W MSB1P21339 1137 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W RLP7P40693 322 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W GTS1P40956 396 aa6.3□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W PEX14P53112 341 aa6.3□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W VPS30Q02948 557 aa6.3□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W YMR187CQ03236 431 aa6.3□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W NKP2Q06162 153 aa6.3□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W RAD50P12753 1312 aa6.29□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W APL1P27351 700 aa6.29□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W PTC7P38797 343 aa6.29□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W GZF3P42944 551 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W HXT16P47185 567 aa6.29□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W RIA1P53893 1110 aa6.29□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W LRS4Q04087 347 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W SLX4Q12098 748 aa6.29□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W RPO41P13433 1351 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W DIF1O13577 133 aa6.28□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W KIN2P13186 1147 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W YCK2P23292 546 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W YCL002CP25565 263 aa6.28□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W CYS3P31373 394 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W SAP190P36123 1033 aa6.28□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W HSL7P38274 827 aa6.28□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W CEP3P40969 608 aa6.28□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W SHR5P41912 237 aa6.28□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W DSD1P53095 428 aa6.28□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W SND1Q04007 877 aa6.28□□□□□ -1.4
VHS1YDR247W APC1P53886 1748 aa6.27□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W CHS2P14180 963 aa6.27□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W STE13P33894 931 aa6.27□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W DUG1P43616 481 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W RAI1P53063 387 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W RSC1P53236 928 aa6.27□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W HDA1P53973 706 aa6.27□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W BNI1P41832 1953 aa6.26□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W TYE7P33122 291 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W PGM1P33401 570 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W AKL1P38080 1108 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W RFC1P38630 861 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W YNG2P38806 282 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W SET5P38890 526 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W DAS1P47005 663 aa6.26□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W YGR153WP48238 217 aa6.26□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W RSM24Q03976 319 aa6.26□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W CSI1Q04368 295 aa6.26□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W YPR053CQ6Q5F3 151 aa6.26□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W YBR182C-AQ8TGU6 64 aa6.26□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W PRC1P00729 532 aa6.25□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W AEP2P22136 580 aa6.25□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W PLC1P32383 869 aa6.25□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W SRP101P32916 621 aa6.25□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W RET2P43621 546 aa6.25□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W MNN11P46985 422 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W UBC9P50623 157 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W PUS2P53167 370 aa6.25□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W SPO1P53541 631 aa6.25□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W YNL050CP53952 270 aa6.25□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W YKR011CQ02209 353 aa6.25□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W SSY1Q03770 852 aa6.25□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W YDR338CQ05497 695 aa6.25□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W YOR378WQ08902 515 aa6.25□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W NOP58Q12499 511 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W ATP4P05626 244 aa6.24□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W HSF1P10961 833 aa6.24□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W MIH1P23748 554 aa6.24□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W ADP1P25371 1049 aa6.24□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W CCR4P31384 837 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W TFC4P33339 1025 aa6.24□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W TDA3P38758 523 aa6.24□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W BDH2P39713 417 aa6.24□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W NPA3P47122 385 aa6.24□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W FOL2P51601 243 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
VHS1YDR247W NPY1P53164 384 aa6.24□□□□□ -1.41
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