RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W DMC1P25453 334 aa4.51□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W BCD1P38772 366 aa4.51□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W SHR5P41912 237 aa4.51□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W ALG2P43636 503 aa4.51□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W TEL2P53038 688 aa4.51□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W ATP25Q03153 612 aa4.51□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W ADY2P25613 283 aa4.5□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W TMT1P32643 299 aa4.5□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W CBR1P38626 284 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W HOS4P40480 1083 aa4.5□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W RLP7P40693 322 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W BUD6P41697 788 aa4.5□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W ZIP2P53061 704 aa4.5□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W YAP1802P53309 568 aa4.5□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W ORC1P54784 914 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W GPR1Q12361 961 aa4.5□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W YBR182C-AQ8TGU6 64 aa4.5□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W AIM44Q99299 758 aa4.5□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W DIF1O13577 133 aa4.49□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W UBC11P52492 156 aa4.49□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W SEC5P89102 971 aa4.49□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W GAD1Q04792 585 aa4.49□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W ASM4Q05166 528 aa4.49□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W THI7Q05998 598 aa4.49□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W MET7Q08645 548 aa4.49□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W YLR125WQ12138 136 aa4.49□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W CIT2P08679 460 aa4.48□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W TIM23P32897 222 aa4.48□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W BET3P36149 193 aa4.48□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W REV7P38927 245 aa4.48□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W ECM1P39715 212 aa4.48□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W NUP82P40368 713 aa4.48□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W BAP3P41815 604 aa4.48□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W GLO1P50107 326 aa4.48□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W RTA1P53047 317 aa4.48□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W YBP2P53169 641 aa4.48□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W SMX3P54999 86 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data4.47□□□□□ -1.69not detected
NSE4YDL105W PHO8P11491 566 aa4.47□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W PPG1P32838 368 aa4.47□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W SPC29P33419 253 aa4.47□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W TEX1P53851 422 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W APM1Q00776 475 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
NSE4YDL105W HIR1P32479 840 aa4.46□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W HXT16P47185 567 aa4.46□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W ERR1P0CX10 437 aa4.45□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W ERR2P0CX11 437 aa4.45□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W THI4P32318 326 aa4.45□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W NMD2P38798 1089 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W CCT3P39077 534 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W YJL206CP39529 758 aa4.45□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W RNH70P53331 553 aa4.45□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W SIR3P06701 978 aa4.44□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W SPO11P23179 398 aa4.44□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W GDH3P39708 457 aa4.44□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W ALY2P47029 1046 aa4.44□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W PRP31P49704 494 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W CTK1Q03957 528 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W POB3Q04636 552 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W TAF3Q12297 353 aa4.44□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W PER1P25625 357 aa4.43□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W RRP14P36080 434 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W NDC80P40460 691 aa4.43□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W YKL033W-AQ86ZR7 236 aa4.43□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W RPN13O13563 156 aa4.42□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W PYC1P11154 1178 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W ARG2P40360 574 aa4.42□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W APL2P36000 726 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W APT2P36973 181 aa4.41□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W CCT7P42943 550 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W TY4A-JP47023 414 aa4.41□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W CTR1P49573 406 aa4.41□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W ALG12P53730 551 aa4.41□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W ORC4P54791 529 aa4.41□□□□□ -1.7
NSE4YDL105W GSY1P23337 708 aa4.4□□□□□ -1.71
NSE4YDL105W MVD1P32377 396 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
NSE4YDL105W ORC2P32833 620 aa4.4□□□□□ -1.71
NSE4YDL105W GLG1P36143 616 aa4.4□□□□□ -1.71
NSE4YDL105W NUP60P39705 539 aa4.4□□□□□ -1.71
NSE4YDL105W PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
NSE4YDL105W MTL1P53214 551 aa4.4□□□□□ -1.71
NSE4YDL105W YDR338CQ05497 695 aa4.4□□□□□ -1.71
NSE4YDL105W MRI1Q06489 411 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
NSE4YDL105W MCM21Q06675 368 aa4.4□□□□□ -1.71
NSE4YDL105W ADE2P21264 571 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
NSE4YDL105W MSH2P25847 964 aa4.39□□□□□ -1.71
NSE4YDL105W YHR112CP38716 378 aa4.39□□□□□ -1.71
NSE4YDL105W SFB3P38810 929 aa4.39□□□□□ -1.71
NSE4YDL105W FMO1P38866 432 aa4.39□□□□□ -1.71
NSE4YDL105W BDH2P39713 417 aa4.39□□□□□ -1.71
NSE4YDL105W YEL020CP39994 560 aa4.39□□□□□ -1.71
NSE4YDL105W BNA2P47125 453 aa4.39□□□□□ -1.71
NSE4YDL105W ARG5,6Q01217 863 aa4.39□□□□□ -1.71
NSE4YDL105W UGO1Q03327 502 aa4.39□□□□□ -1.71
NSE4YDL105W PEX6P33760 1030 aa4.38□□□□□ -1.71
NSE4YDL105W DSS1P39112 969 aa4.38□□□□□ -1.71
NSE4YDL105W YFL052WP43551 465 aa4.38□□□□□ -1.71
NSE4YDL105W ATG4P53867 494 aa4.38□□□□□ -1.71
NSE4YDL105W MTC2P34246 357 aa4.37□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 33.1 ms