RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

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Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIP4K2BP78356 416 aa6.66□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 POU4F2Q12837 409 aa6.66□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANO2Q9NQ90 1003 aa6.66□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.66□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHMP3Q9Y3E7 222 aa6.66□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa6.66□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.65□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 LTKP29376 864 aa6.65□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 TXLNAP40222 546 aa6.65□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 PHKA2P46019 1235 aa6.65□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLA2G4AP47712 749 aa6.65□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTMR3Q13615 1198 aa6.65□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 GNASQ5JWF2 1037 aa6.65□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 COX20Q5RI15 118 aa6.65□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.65□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 NGLY1Q96IV0 654 aa6.65□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa6.65□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.65□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 DISP3Q9P2K9 1392 aa6.65□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 HFM1A2PYH4 1435 aa6.65□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa6.65□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 RHOQP17081 205 aa6.64□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 IDI1Q13907 227 aa6.64□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.64□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.64□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.64□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.64□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 ICMTO60725 284 aa6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 ECM1Q16610 540 aa6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 C16orf46Q6P387 395 aa6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYO19Q96H55 970 aa6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC26A8Q96RN1 970 aa6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 EID1Q9Y6B2 187 aa6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 H3BRB1 525 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 HELQQ8TDG4 1101 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 AIDAQ96BJ3 306 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 KNDC1Q76NI1 1749 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 NHSL1Q5SYE7 1610 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM94Q12767 1356 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 SOBPA7XYQ1 873 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNFRSF10BO14763 440 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 RTN1Q16799 776 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDR44Q5JSH3 913 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM26DQ5JW98 314 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLRG1Q96E93 195 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPR3P17342 541 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP4AP20648 1035 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 MPSTP25325 297 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSPA1LP34931 641 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLK14Q9P0G3 267 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 SHPRHQ149N8 1683 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 LAMC1P11047 1609 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAN1A2O60476 641 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARHGAP4P98171 946 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 DGKZQ13574 1117 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 NBPF1Q3BBV0 1214 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC52A1Q9NWF4 448 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 STIM2Q9P246 746 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTPRUQ92729 1446 aa6.59□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1B0GTH6 734 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZBTB39O15060 712 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 TOM1O60784 492 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 MSX1P28360 303 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC27Q2M243 656 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 RHPN1Q8TCX5 695 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 BCS1LQ9Y276 419 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 MSH6P52701 1360 aa6.57□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 TATP17735 454 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 BRD2P25440 801 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RPS3AP54-201ENST00000435535 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa6.57□□□□□ -1.36
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