RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

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Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.52■□□□□ 0.4
RPS3AP54-201ENST00000435535 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
RPS3AP54-201ENST00000435535 FOXD1Q16676 465 aa14.31□□□□□ -0.12
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLPPR3Q6T4P5 718 aa14.31□□□□□ -0.12
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP6R1Q9UPN7 881 aa13.57□□□□□ -0.24
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADRA2BP18089 450 aa13.55□□□□□ -0.24
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RPS3AP54-201ENST00000435535 MSH5O43196 834 aa13.29□□□□□ -0.28
RPS3AP54-201ENST00000435535 POTEDQ86YR6 584 aa13.26□□□□□ -0.29
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNA4P22459 653 aa12.67□□□□□ -0.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa12.66□□□□□ -0.38
RPS3AP54-201ENST00000435535 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
RPS3AP54-201ENST00000435535 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa12.24□□□□□ -0.45
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPM3O75607 178 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
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RPS3AP54-201ENST00000435535 DMRT2Q9Y5R5 561 aa12.08□□□□□ -0.48
RPS3AP54-201ENST00000435535 EHMT2Q96KQ7 1210 aa12.05□□□□□ -0.48
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RPS3AP54-201ENST00000435535 CSRNP3Q8WYN3 585 aa11.81□□□□□ -0.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNAJC5BQ9UF47 199 aa11.81□□□□□ -0.52
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCAF8L1A6NGE4 600 aa11.71□□□□□ -0.53
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZBTB22O15209 634 aa11.69□□□□□ -0.54
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RPS3AP54-201ENST00000435535 FOXD4L1Q9NU39 408 aa11.56□□□□□ -0.56
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC4A2P04920 1241 aa11.51□□□□□ -0.57
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF39Q9H2S5 420 aa11.39□□□□□ -0.59
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RPS3AP54-201ENST00000435535 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP11.25□□□□□ -0.61
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATXN8OSP0DMR3 200 aa11.11□□□□□ -0.63
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RPS3AP54-201ENST00000435535 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 NISCHQ9Y2I1 1504 aa10.92□□□□□ -0.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 APLP2Q06481 763 aa10.81□□□□□ -0.68
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RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
RPS3AP54-201ENST00000435535 CAPN15O75808 1086 aa10.74□□□□□ -0.69
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RPS3AP54-201ENST00000435535 POLA2Q14181 598 aa10.58□□□□□ -0.72
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABCB7O75027 752 aa10.55□□□□□ -0.72
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RPS3AP54-201ENST00000435535 FBLN2P98095 1184 aa10.44□□□□□ -0.74
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RPS3AP54-201ENST00000435535 POTEHQ6S545 545 aa10.35□□□□□ -0.75
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RPS3AP54-201ENST00000435535 OSCARQ8IYS5 282 aa10.21□□□□□ -0.77
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RPS3AP54-201ENST00000435535 FBXO3Q9UK99 471 aa10.15□□□□□ -0.78
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPDYE2BA6NHP3 402 aa10.14□□□□□ -0.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPDYE6P0CI01 402 aa10.14□□□□□ -0.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPDYE2Q495Y8 402 aa10.14□□□□□ -0.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 SSUH2Q9Y2M2 353 aa10.11□□□□□ -0.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 VASPP50552 380 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP10.03□□□□□ -0.8
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RPS3AP54-201ENST00000435535 STAG3Q9UJ98 1225 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa9.89□□□□□ -0.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 AKT1S1Q96B36 256 aa9.86□□□□□ -0.83
RPS3AP54-201ENST00000435535 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLCD3Q8N3E9 789 aa9.82□□□□□ -0.84
RPS3AP54-201ENST00000435535 MIER1Q8N108 512 aa9.8□□□□□ -0.84
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLHL34Q8N239 644 aa9.79□□□□□ -0.84
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RPS3AP54-201ENST00000435535 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.75□□□□□ -0.85
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPOCK2Q92563 424 aa9.75□□□□□ -0.85
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLEC11AQ9Y240 323 aa9.74□□□□□ -0.85
RPS3AP54-201ENST00000435535 PKD2Q13563 968 aa9.72□□□□□ -0.85
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABCC9O60706 1549 aa9.72□□□□□ -0.85
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLEKHG5O94827 1062 aa9.68□□□□□ -0.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRR29P0C7W0 189 aa9.68□□□□□ -0.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
RPS3AP54-201ENST00000435535 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
RPS3AP54-201ENST00000435535 CREBZFQ9NS37 354 aa9.64□□□□□ -0.87
RPS3AP54-201ENST00000435535 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.63□□□□□ -0.87
RPS3AP54-201ENST00000435535 HAX1O00165 279 aa9.61□□□□□ -0.87
RPS3AP54-201ENST00000435535 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUBP1P53384 320 aa9.56□□□□□ -0.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 EVX2Q03828 476 aa9.56□□□□□ -0.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCAF8L2P0C7V8 631 aa9.54□□□□□ -0.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC24A1O60721 1099 aa9.53□□□□□ -0.88
RPS3AP54-201ENST00000435535 RGL2O15211 777 aa9.51□□□□□ -0.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHADLQ6NUI6 762 aa9.51□□□□□ -0.89
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