RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000022095.9

Irx4-201, Transcript of Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Irx4, Length 2,589 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4-201ENSMUST00000022095 Trim56Q80VI1 734 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
Irx4-201ENSMUST00000022095 Tmem266Q8BZB3 538 aa29.1■■■□□ 2.25
Irx4-201ENSMUST00000022095 Sh3bp5Q9Z131 463 aa29.1■■■□□ 2.25
Irx4-201ENSMUST00000022095 Ifit1bl2Q3U687 466 aa29.1■■■□□ 2.25
Irx4-201ENSMUST00000022095 Rassf8Q8CJ96 419 aa29.1■■■□□ 2.25
Irx4-201ENSMUST00000022095 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
Irx4-201ENSMUST00000022095 Prl7a2O54831 253 aa29.09■■■□□ 2.25
Irx4-201ENSMUST00000022095 Atp2b3Q0VF55 1220 aa29.09■■■□□ 2.25
Irx4-201ENSMUST00000022095 TsksO54887 585 aa29.09■■■□□ 2.25
Irx4-201ENSMUST00000022095 Fkbp1aP26883 108 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
Irx4-201ENSMUST00000022095 Trim34bJ3QNR8 485 aa29.08■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 Kcnq3Q8K3F6 873 aa29.08■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 Trim34aQ99PP6 485 aa29.08■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 Rnf20Q5DTM8 973 aa29.07■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 MypopQ8R4U1 393 aa29.07■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 Ubap1lG3UW59 384 aa29.07■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 Vps33bP59016 617 aa29.07■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 Bms1Q6PGF5 1284 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 RubcnlQ3TD16 648 aa29.06■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 Popdc2Q9ES82 367 aa29.06■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 Sema6bO54951 886 aa29.06■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 Rps6kb1Q8BSK8 525 aa29.06■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 Erc1Q99MI1 1120 aa29.06■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 Smc3Q9CW03 1217 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 Sptlc3Q8BG54 563 aa29.05■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 Atp8a2P98200 1148 aa29.05■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 Cyp3a57D3YYZ0 503 aa29.04■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 Smarcc1P97496 1104 aa29.04■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 Rdm1Q9CQK3 281 aa29.04■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 NgdnQ9DB96 315 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 Il4rP16382 810 aa29.04■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 Cchcr1Q8K2I2 770 aa29.04■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 Sept12Q9D451 317 aa29.04■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 Lekr1B2RVN1 116 aa29.03■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 Usp48Q3V0C5 1052 aa29.03■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 SnrkQ8VDU5 748 aa29.03■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 Psma5Q9Z2U1 241 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 Irgm2A0A140LIF8 407 aa29.02■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 Babam1Q3UI43 333 aa29.02■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 Ptcd1Q8C2E4 695 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 Hspd1P63038 573 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 DpydQ8CHR6 1025 aa29.02■■■□□ 2.24
Irx4-201ENSMUST00000022095 Gm13023A2A8N2 498 aa29.01■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 EappQ5BU09 281 aa29.01■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Tmx3Q8BXZ1 456 aa29.01■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Usp44Q8C2S0 711 aa29.01■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa29.01■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Slc38a10Q5I012 1090 aa29.01■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Map10Q8BJS7 891 aa29.01■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Emilin1Q99K41 1017 aa29.01■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Mapk8ip1Q9WVI9 707 aa29.01■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Ltbp1Q8CG19 1712 aa29■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Rps6ka4Q9Z2B9 773 aa29■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Pde8bE9Q4S1 865 aa29■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Hmg20bQ9Z104 317 aa29■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Gm9992B2RWK3 458 aa28.99■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Unc93aQ710D3 458 aa28.99■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Snai1Q02085 264 aa28.99■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Hand2Q61039 217 aa28.99■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Nlrp9aQ66X03 949 aa28.99■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Edrf1Q6GQV7 1239 aa28.99■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 PtmsQ9D0J8 101 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Stx6Q9JKK1 255 aa28.99■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 4931408C20RikE9PWP9 1381 aa28.99■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Ppfia3P60469 1194 aa28.98■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa28.98■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Ctdnep1Q3TP92 244 aa28.98■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Nyap1Q6PFX7 833 aa28.98■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Ripk4Q9ERK0 786 aa28.98■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Pdia4P08003 638 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 AidaQ8C4Q6 305 aa28.97■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Mctp2Q5RJH2 878 aa28.97■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Ccdc158Q8CDI6 1109 aa28.97■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Sytl4Q9R0Q1 673 aa28.97■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Col22a1E9Q7P1 1613 aa28.96■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 1700006A11RikB9EHI3 544 aa28.96■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Ddrgk1Q80WW9 315 aa28.96■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Rbm33Q9CXK9 1231 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Lama4P97927 1816 aa28.96■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Sept1P42209 366 aa28.96■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Plekhf1Q3TB82 279 aa28.96■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa28.96■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Tktl2Q9D4D4 627 aa28.96■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 CltaO08585 235 aa28.95■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Zc3h12cQ5DTV4 884 aa28.95■■■□□ 2.23
Irx4-201ENSMUST00000022095 Tmem67Q8BR76 992 aa28.95■■■□□ 2.22
Irx4-201ENSMUST00000022095 Shisa4Q8CA71 197 aa28.95■■■□□ 2.22
Irx4-201ENSMUST00000022095 Stox1B2RQL2 990 aa28.94■■■□□ 2.22
Irx4-201ENSMUST00000022095 Atp1b3P97370 278 aa28.94■■■□□ 2.22
Irx4-201ENSMUST00000022095 Srp68Q8BMA6 625 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
Irx4-201ENSMUST00000022095 Dnajc14Q921R4 703 aa28.94■■■□□ 2.22
Irx4-201ENSMUST00000022095 Kcnq5Q9JK45 933 aa28.94■■■□□ 2.22
Irx4-201ENSMUST00000022095 Eef2kO08796 724 aa28.94■■■□□ 2.22
Irx4-201ENSMUST00000022095 Fam160b2Q80YR2 744 aa28.94■■■□□ 2.22
Irx4-201ENSMUST00000022095 Ppil4Q9CXG3 492 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
Irx4-201ENSMUST00000022095 Cyp2d34L7N463 504 aa28.93■■■□□ 2.22
Irx4-201ENSMUST00000022095 Cyp2d9P11714 504 aa28.93■■■□□ 2.22
Irx4-201ENSMUST00000022095 Naa30Q8CES0 364 aa28.93■■■□□ 2.22
Irx4-201ENSMUST00000022095 Ppfibp2O35711 882 aa28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 47.4 ms