Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB82

Plekhf1, Pleckstrin homology domain-containing family F member 1, mousemouse

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Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhf1Q3TB82 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46,99■■■■■ 5,11
Plekhf1Q3TB82 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC43,42■■■■■ 4,54
Plekhf1Q3TB82 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,76■■■■■ 4,44
Plekhf1Q3TB82 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41,09■■■■■ 4,17
Plekhf1Q3TB82 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40,77■■■■■ 4,12
Plekhf1Q3TB82 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,69■■■■■ 4,1
Plekhf1Q3TB82 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40,29■■■■■ 4,04
Plekhf1Q3TB82 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,94■■■■□ 3,98
Plekhf1Q3TB82 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,77■■■■□ 3,96
Plekhf1Q3TB82 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,68■■■■□ 3,94
Plekhf1Q3TB82 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,39■■■■□ 3,9
Plekhf1Q3TB82 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39,24■■■■□ 3,87
Plekhf1Q3TB82 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39,2■■■■□ 3,87
Plekhf1Q3TB82 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,02■■■■□ 3,84
Plekhf1Q3TB82 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,44■■■■□ 3,74
Plekhf1Q3TB82 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,38■■■■□ 3,73
Plekhf1Q3TB82 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38,21■■■■□ 3,71
Plekhf1Q3TB82 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,04■■■■□ 3,68
Plekhf1Q3TB82 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37,93■■■■□ 3,66
Plekhf1Q3TB82 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37,92■■■■□ 3,66
Plekhf1Q3TB82 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,92■■■■□ 3,66
Plekhf1Q3TB82 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37,72■■■■□ 3,63
Plekhf1Q3TB82 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,68■■■■□ 3,62
Plekhf1Q3TB82 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,61■■■■□ 3,61
Plekhf1Q3TB82 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,59■■■■□ 3,61
Plekhf1Q3TB82 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,56■■■■□ 3,6
Plekhf1Q3TB82 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,52■■■■□ 3,6
Plekhf1Q3TB82 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37,5■■■■□ 3,59
Plekhf1Q3TB82 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37,44■■■■□ 3,58
Plekhf1Q3TB82 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,43■■■■□ 3,58
Plekhf1Q3TB82 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,31■■■■□ 3,56
Plekhf1Q3TB82 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,25■■■■□ 3,55
Plekhf1Q3TB82 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,2■■■■□ 3,55
Plekhf1Q3TB82 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,14■■■■□ 3,54
Plekhf1Q3TB82 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC37,12■■■■□ 3,53
Plekhf1Q3TB82 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36,96■■■■□ 3,51
Plekhf1Q3TB82 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,8■■■■□ 3,48
Plekhf1Q3TB82 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36,71■■■■□ 3,47
Plekhf1Q3TB82 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,42■■■■□ 3,42
Plekhf1Q3TB82 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,42■■■■□ 3,42
Plekhf1Q3TB82 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
Plekhf1Q3TB82 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36,33■■■■□ 3,41
Plekhf1Q3TB82 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Plekhf1Q3TB82 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36,19■■■■□ 3,38
Plekhf1Q3TB82 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Plekhf1Q3TB82 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Plekhf1Q3TB82 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36,07■■■■□ 3,36
Plekhf1Q3TB82 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36,01■■■■□ 3,35
Plekhf1Q3TB82 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Plekhf1Q3TB82 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,94■■■■□ 3,34
Plekhf1Q3TB82 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35,92■■■■□ 3,34
Plekhf1Q3TB82 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,85■■■■□ 3,33
Plekhf1Q3TB82 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35,8■■■■□ 3,32
Plekhf1Q3TB82 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35,71■■■■□ 3,31
Plekhf1Q3TB82 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
Plekhf1Q3TB82 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35,55■■■■□ 3,28
Plekhf1Q3TB82 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
Plekhf1Q3TB82 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
Plekhf1Q3TB82 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Plekhf1Q3TB82 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
Plekhf1Q3TB82 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35,4■■■■□ 3,26
Plekhf1Q3TB82 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Plekhf1Q3TB82 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,34■■■■□ 3,25
Plekhf1Q3TB82 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35,32■■■■□ 3,24
Plekhf1Q3TB82 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,23
Plekhf1Q3TB82 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35,19■■■■□ 3,22
Plekhf1Q3TB82 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Plekhf1Q3TB82 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Plekhf1Q3TB82 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35,07■■■■□ 3,21
Plekhf1Q3TB82 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35,06■■■■□ 3,2
Plekhf1Q3TB82 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Plekhf1Q3TB82 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35,04■■■■□ 3,2
Plekhf1Q3TB82 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35,01■■■■□ 3,2
Plekhf1Q3TB82 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
Plekhf1Q3TB82 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
Plekhf1Q3TB82 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
Plekhf1Q3TB82 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34,97■■■■□ 3,19
Plekhf1Q3TB82 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,96■■■■□ 3,19
Plekhf1Q3TB82 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Plekhf1Q3TB82 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Plekhf1Q3TB82 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Plekhf1Q3TB82 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34,86■■■■□ 3,17
Plekhf1Q3TB82 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,84■■■■□ 3,17
Plekhf1Q3TB82 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Plekhf1Q3TB82 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
Plekhf1Q3TB82 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34,71■■■■□ 3,15
Plekhf1Q3TB82 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34,68■■■■□ 3,14
Plekhf1Q3TB82 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34,68■■■■□ 3,14
Plekhf1Q3TB82 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Plekhf1Q3TB82 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34,67■■■■□ 3,14
Plekhf1Q3TB82 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Plekhf1Q3TB82 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Plekhf1Q3TB82 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Plekhf1Q3TB82 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,55■■■■□ 3,12
Plekhf1Q3TB82 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34,49■■■■□ 3,11
Plekhf1Q3TB82 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Plekhf1Q3TB82 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Plekhf1Q3TB82 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Plekhf1Q3TB82 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34,37■■■■□ 3,09
Plekhf1Q3TB82 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34,36■■■■□ 3,09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30,4 ms