Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46,54■■■■■ 5,04
Sept1P42209 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42,96■■■■■ 4,47
Sept1P42209 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,36■■■■■ 4,37
Sept1P42209 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40,79■■■■■ 4,12
Sept1P42209 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,67■■■■■ 4,1
Sept1P42209 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40,31■■■■■ 4,04
Sept1P42209 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39,96■■■■□ 3,99
Sept1P42209 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,9■■■■□ 3,98
Sept1P42209 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,48■■■■□ 3,91
Sept1P42209 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,36■■■■□ 3,89
Sept1P42209 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,29■■■■□ 3,88
Sept1P42209 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38,92■■■■□ 3,82
Sept1P42209 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38,86■■■■□ 3,81
Sept1P42209 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,67■■■■□ 3,78
Sept1P42209 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,36■■■■□ 3,73
Sept1P42209 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,08■■■■□ 3,69
Sept1P42209 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38,07■■■■□ 3,68
Sept1P42209 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,84■■■■□ 3,65
Sept1P42209 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,72■■■■□ 3,63
Sept1P42209 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37,65■■■■□ 3,62
Sept1P42209 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,54■■■■□ 3,6
Sept1P42209 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37,51■■■■□ 3,59
Sept1P42209 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37,48■■■■□ 3,59
Sept1P42209 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Sept1P42209 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,44■■■■□ 3,58
Sept1P42209 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
Sept1P42209 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
Sept1P42209 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37,3■■■■□ 3,56
Sept1P42209 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37,25■■■■□ 3,55
Sept1P42209 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,04■■■■□ 3,52
Sept1P42209 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,02■■■■□ 3,52
Sept1P42209 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,87■■■■□ 3,49
Sept1P42209 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,86■■■■□ 3,49
Sept1P42209 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,84■■■■□ 3,49
Sept1P42209 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36,72■■■■□ 3,47
Sept1P42209 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36,62■■■■□ 3,45
Sept1P42209 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36,59■■■■□ 3,45
Sept1P42209 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,44■■■■□ 3,42
Sept1P42209 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
Sept1P42209 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
Sept1P42209 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,31■■■■□ 3,4
Sept1P42209 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
Sept1P42209 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,03■■■■□ 3,36
Sept1P42209 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35,99■■■■□ 3,35
Sept1P42209 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35,9■■■■□ 3,34
Sept1P42209 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35,89■■■■□ 3,34
Sept1P42209 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Sept1P42209 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,82■■■■□ 3,33
Sept1P42209 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35,8■■■■□ 3,32
Sept1P42209 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35,65■■■■□ 3,3
Sept1P42209 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,65■■■■□ 3,3
Sept1P42209 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35,64■■■■□ 3,3
Sept1P42209 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35,59■■■■□ 3,29
Sept1P42209 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,49■■■■□ 3,27
Sept1P42209 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Sept1P42209 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35,42■■■■□ 3,26
Sept1P42209 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Sept1P42209 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35,36■■■■□ 3,25
Sept1P42209 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35,33■■■■□ 3,25
Sept1P42209 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
Sept1P42209 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,15■■■■□ 3,22
Sept1P42209 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Sept1P42209 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Sept1P42209 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35,05■■■■□ 3,2
Sept1P42209 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Sept1P42209 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35,03■■■■□ 3,2
Sept1P42209 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34,99■■■■□ 3,19
Sept1P42209 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
Sept1P42209 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,97■■■■□ 3,19
Sept1P42209 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,96■■■■□ 3,19
Sept1P42209 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34,94■■■■□ 3,18
Sept1P42209 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Sept1P42209 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34,9■■■■□ 3,18
Sept1P42209 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Sept1P42209 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34,83■■■■□ 3,17
Sept1P42209 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,8■■■■□ 3,16
Sept1P42209 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,16
Sept1P42209 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
Sept1P42209 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Sept1P42209 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34,71■■■■□ 3,15
Sept1P42209 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Sept1P42209 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34,61■■■■□ 3,13
Sept1P42209 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34,61■■■■□ 3,13
Sept1P42209 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34,59■■■■□ 3,13
Sept1P42209 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Sept1P42209 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Sept1P42209 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Sept1P42209 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34,49■■■■□ 3,11
Sept1P42209 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,43■■■■□ 3,1
Sept1P42209 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34,42■■■■□ 3,1
Sept1P42209 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Sept1P42209 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Sept1P42209 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Sept1P42209 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Sept1P42209 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34,31■■■■□ 3,08
Sept1P42209 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Sept1P42209 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34,1■■■■□ 3,05
Sept1P42209 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Sept1P42209 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34,1■■■■□ 3,05
Sept1P42209 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34,07■■■■□ 3,04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms