RNA–Protein interactions for RNA: tL(CAA)C

SUP53, Transcript of Leucine tRNA (tRNA-Leu), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene SUP53, Length 82 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUP53tL(CAA)C SRX1P36077 127 aa4.27□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C DCW1P36091 449 aa4.27□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C BCH2P36122 765 aa4.27□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C TIF5P38431 405 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C CIC1P38779 376 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C RAD55P38953 406 aa4.27□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C AKR1P39010 764 aa4.27□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C POL31P46957 487 aa4.27□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C SMA1Q02651 245 aa4.27□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C YDL129WQ07555 291 aa4.27□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C PUS1Q12211 544 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C GAL80P04387 435 aa4.26□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C REV1P12689 985 aa4.26□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C FPR1P20081 114 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C SRO9P25567 434 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C RML2P32611 393 aa4.26□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C WBP1P33767 430 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C AAP1P37898 856 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C UME6P39001 836 aa4.26□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C IES1P43579 692 aa4.26□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C VTC2P43585 828 aa4.26□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C YGR130CP53278 816 aa4.26□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C CSL4P53859 292 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C ARK1P53974 638 aa4.26□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C TRS130Q03660 1102 aa4.26□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C HPF1Q05164 967 aa4.26□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C CDD1Q06549 142 aa4.26□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C CDC45Q08032 650 aa4.26□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C SRD1P09007 221 aa4.25□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C KGD2P19262 463 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C KIN3P22209 435 aa4.25□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C SLA2P33338 968 aa4.25□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C MIC60P36112 540 aa4.25□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C YKR051WP36142 418 aa4.25□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C PIK1P39104 1066 aa4.25□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C BIM1P40013 344 aa4.25□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C PCI8P40512 444 aa4.25□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C ERG10P41338 398 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C BFA1P47113 574 aa4.25□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C YGL138CP53122 345 aa4.25□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C CUL3P53202 744 aa4.25□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C DSE4P53753 1117 aa4.25□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C BNI5P53890 448 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C MFM1Q02783 413 aa4.25□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C ECM7Q06200 448 aa4.25□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C FLC1Q08967 793 aa4.25□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C SAM3Q08986 587 aa4.25□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C NDJ1Q12366 352 aa4.25□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C CTF3Q12748 733 aa4.25□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C TPK1P06244 397 aa4.24□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C MTF1P14908 341 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C PEP3P27801 918 aa4.24□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C COT1P32798 439 aa4.24□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C TFA1P36100 482 aa4.24□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C BAT1P38891 393 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C ATG32P40458 529 aa4.24□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C SUM1P46676 1062 aa4.24□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C FYV8P46949 817 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C NPY1P53164 384 aa4.24□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C NRM1P53718 249 aa4.24□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C TDA7P53882 636 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C ECM23Q02710 187 aa4.24□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C CWC21Q03375 135 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C SDH5Q08230 162 aa4.24□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C HRP1Q99383 534 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C MSF1P08425 469 aa4.23□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C SKG6P32900 734 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C PGM2P37012 569 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C YBR238CP38330 731 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C PPX1P38698 397 aa4.23□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C GDH3P39708 457 aa4.23□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C BTT1P40314 149 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C MNN10P50108 393 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C ORC5P50874 479 aa4.23□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C PGA2P53903 129 aa4.23□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data4.23□□□□□ -1.73not detected
SUP53tL(CAA)C GCN5Q03330 439 aa4.23□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C SEG1Q04279 960 aa4.23□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C YDL057WQ07379 328 aa4.23□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C SHS1Q07657 551 aa4.23□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C BI4P03879 638 aa4.22□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C STE4P18851 423 aa4.22□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C GSY1P23337 708 aa4.22□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C GUT1P32190 709 aa4.22□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C CDC27P38042 758 aa4.22□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C YBL036CP38197 257 aa4.22□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C PFS1P38872 237 aa4.22□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C RPN3P40016 523 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C VEL1P53058 206 aa4.22□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C NCS2P53923 493 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C YOR387CQ08910 206 aa4.22□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C YOR389WQ08912 624 aa4.22□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C YPL278CQ08990 100 aa4.22□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C SUL2Q12325 893 aa4.22□□□□□ -1.73
SUP53tL(CAA)C GAL4P04386 881 aa4.21□□□□□ -1.74
SUP53tL(CAA)C RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
SUP53tL(CAA)C RPL43BP0CX26 92 aa4.21□□□□□ -1.74
SUP53tL(CAA)C TAF13P11747 167 aa4.21□□□□□ -1.74
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