RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C FLC1Q08967 793 aa2.66□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C MET3P08536 511 aa2.65□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C DAL7P21826 554 aa2.65□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C SPC42P36094 363 aa2.65□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C PPS1P38148 807 aa2.65□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C SIC1P38634 284 aa2.65□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C YHL017WP38745 532 aa2.65□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C GGA2P38817 585 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C RSP5P39940 809 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C SDS3P40505 327 aa2.65□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C DAS1P47005 663 aa2.65□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C NIT3P49954 291 aa2.65□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C MUP1P50276 574 aa2.65□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C TAD1P53065 400 aa2.65□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C HUL5P53119 910 aa2.65□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C DAM1P53267 343 aa2.65□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C YGR125WP53273 1036 aa2.65□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C LRS4Q04087 347 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data2.65□□□□□ -1.98not detected
HDA3YPR179C YBR182C-AQ8TGU6 64 aa2.65□□□□□ -1.98
HDA3YPR179C YLR415CO13578 112 aa2.65□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C CAF20P12962 161 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C OCA5P38738 679 aa2.65□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C HUL4P40985 892 aa2.65□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C FKH2P41813 862 aa2.65□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C TIM54P47045 478 aa2.65□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C AMA1P50082 593 aa2.65□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C PUS2P53167 370 aa2.65□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C GND2P53319 492 aa2.65□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C REH1Q06709 432 aa2.65□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C YOR022CQ12204 715 aa2.65□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C CAN1P04817 590 aa2.64□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C SNM1P40993 198 aa2.64□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C PFA3P42836 336 aa2.64□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C ALG2P43636 503 aa2.64□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C YJL163CP46996 555 aa2.64□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C SSY5P47002 699 aa2.64□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C SPC29P33419 253 aa2.63□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C PZF1P39933 429 aa2.63□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C BAP3P41815 604 aa2.63□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C PKH1Q03407 766 aa2.63□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C ATG11Q12527 1178 aa2.63□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C LAT1P12695 482 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C SET5P38890 526 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C SAK1P38990 1142 aa2.63□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C HOS4P40480 1083 aa2.63□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C YIR042CP40586 236 aa2.63□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C NSE3Q05541 303 aa2.63□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C MET7Q08645 548 aa2.63□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C YOL098CQ12496 1037 aa2.63□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C PRC1P00729 532 aa2.62□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C TOM70P07213 617 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C NGG1P32494 702 aa2.62□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C ECM1P39715 212 aa2.62□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C MAL11P53048 616 aa2.62□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C ZIP2P53061 704 aa2.62□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C ORC1P54784 914 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C ASM4Q05166 528 aa2.62□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C TGL5Q12043 749 aa2.62□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data2.61□□□□□ -1.99not detected
HDA3YPR179C RLP7P40693 322 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C LGE1Q02796 332 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C NRG1Q03125 231 aa2.61□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C YDR514CQ04408 483 aa2.61□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C YDR338CQ05497 695 aa2.61□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C YTA7P40340 1379 aa2.61□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C GAL11P19659 1081 aa2.61□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C ILV6P25605 309 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C SRP40P32583 406 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C RSC3Q06639 885 aa2.61□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C IRC13Q08630 104 aa2.61□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C SUT2Q12286 268 aa2.61□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C SIR3P06701 978 aa2.6□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C GFA1P14742 717 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C MTC2P34246 357 aa2.6□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C YBR259WP38338 688 aa2.6□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C GDH3P39708 457 aa2.6□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C FMP52P40008 231 aa2.6□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C ZDS1P50111 915 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C UBC11P52492 156 aa2.6□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C TEX1P53851 422 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C RIA1P53893 1110 aa2.6□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C COQ11Q05892 277 aa2.6□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C SGO1Q08490 590 aa2.6□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C CDC53Q12018 815 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C BCD1P38772 366 aa2.6□□□□□ -1.99
HDA3YPR179C DIF1O13577 133 aa2.59□□□□□ -2
HDA3YPR179C PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data2.59□□□□□ -2not detected
HDA3YPR179C HIR1P32479 840 aa2.59□□□□□ -2
HDA3YPR179C YKL091CP33324 310 aaKnown RBP2.59□□□□□ -2
HDA3YPR179C MCD4P36051 919 aa2.59□□□□□ -2
HDA3YPR179C CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
HDA3YPR179C BUD6P41697 788 aa2.59□□□□□ -2
HDA3YPR179C HSV2P50079 448 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
HDA3YPR179C RPN4Q03465 531 aa2.59□□□□□ -2
HDA3YPR179C SAP190P36123 1033 aa2.58□□□□□ -2
HDA3YPR179C TEL2P53038 688 aa2.58□□□□□ -2
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