RNA–Protein interactions for RNA: YPL207W

TYW1, Iron-sulfer protein required for synthesis of Wybutosine modified tRNA, yeast

Gene TYW1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TYW1	YPL207W	RED1	P14291	827 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	FUN30	P31380	1131 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	SEG2	P34250	1132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	MCM7	P38132	845 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	POP2	P39008	433 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	YIL166C	P40445	542 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	LCD1	Q04377	747 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	RIP-Chip
TYW1	YPL207W	ENA1	P13587	1091 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	MSH1	P25846	959 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	YBL086C	P38177	466 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	DUN1	P39009	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	SAE2	P46946	345 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	VPS53	P47061	822 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	VHS3	Q08438	674 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	CEX1	Q12453	761 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	YOR1	P53049	1477 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	ORC2	P32833	620 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	AXL2	P38928	823 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	SSN3	P39073	555 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	RGA1	P39083	1007 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	SPC72	P39723	622 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	YEL068C	P39977	110 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	SSL2	Q00578	843 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	HFI1	Q12060	488 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	SEM1	O94742	89 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	ATP12	P22135	325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	CCZ1	P38273	704 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	IMA5	P40884	581 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	ADY3	Q07732	790 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	ARP7	Q12406	477 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	APM4	Q99186	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	SLA1	P32790	1244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	AFG2	P32794	780 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	XRS2	P33301	854 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	MTH1	P35198	433 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	SHU2	P38957	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	TOK1	P40310	691 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	SMK1	P41808	388 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	JJJ2	P46997	583 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	ASK10	P48361	1146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	TY2B-C	P25384	1770 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	MTF2	P10849	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	BYE1	P36106	594 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	LAM1	P38851	1228 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	TRM8	Q12009	286 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	PDX1	P16451	410 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	ERG3	P32353	365 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	OAF3	P36023	863 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	ADD66	P36040	267 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	TDA3	P38758	523 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	SKP1	P52286	194 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TYW1	YPL207W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	POL4	P25615	582 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	FAT1	P38225	669 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TYW1	YPL207W	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63

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