RNA–Protein interactions for RNA: YMR094W

CTF13, Transcript of Subunit of the CBF3 complex, yeast

Gene CTF13, Length 1,437 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CTF13	YMR094W	YCL002C	P25565	263 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTF13	YMR094W	EMC3	P36039	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTF13	YMR094W	YHL017W	P38745	532 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTF13	YMR094W	SAK1	P38990	1142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTF13	YMR094W	SSY5	P47002	699 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTF13	YMR094W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTF13	YMR094W	SAP190	P36123	1033 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTF13	YMR094W	HUL4	P40985	892 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTF13	YMR094W	AMA1	P50082	593 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTF13	YMR094W	DAM1	P53267	343 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTF13	YMR094W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTF13	YMR094W	TAF8	Q03750	510 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTF13	YMR094W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CTF13	YMR094W	SDS3	P40505	327 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTF13	YMR094W	GYP8	P43570	497 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTF13	YMR094W	CRR1	Q05790	422 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTF13	YMR094W	YLR415C	O13578	112 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	YBR053C	P38235	358 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	YJL163C	P46996	555 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	NRG1	Q03125	231 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	RSC3	Q06639	885 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	PFA3	P42836	336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	FLC1	Q08967	793 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	YIR042C	P40586	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	REH1	Q06709	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	BET3	P36149	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	ATF1	P40353	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	ALG2	P43636	503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	THI21	Q08975	551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	PCL5	P38794	229 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	YJL049W	P47048	450 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	HUL5	P53119	910 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	IRC13	Q08630	104 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
CTF13	YMR094W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	RIA1	P53893	1110 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	MET7	Q08645	548 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	TGL5	Q12043	749 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
CTF13	YMR094W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	SHR5	P41912	237 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	RTA1	P53047	317 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	ATP25	Q03153	612 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTF13	YMR094W	CAN1	P04817	590 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	ASM4	Q05166	528 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	GPR1	Q12361	961 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	ZIP2	P53061	704 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	BDF2	Q07442	638 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	SUT2	Q12286	268 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	DIF1	O13577	133 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	CDC43	P18898	376 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	SPC29	P33419	253 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	TDP1	P38319	544 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	YBR259W	P38338	688 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	SIC1	P38634	284 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	BCD1	P38772	366 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	HOS4	P40480	1083 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	HXT16	P47185	567 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	SGO1	Q08490	590 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	PER1	P25625	357 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	GAL11	P19659	1081 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	KIN3	P22209	435 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	FMP52	P40008	231 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	UBC11	P52492	156 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	SSL2	Q00578	843 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	ALY2	P47029	1046 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	TEL2	P53038	688 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	GAD1	Q04792	585 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	PPZ2	P33329	710 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	BAP3	P41815	604 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	TAH11	P47112	604 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTF13	YMR094W	PEX2	P32800	271 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	YBP2	P53169	641 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	HIR1	P32479	840 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	REV7	P38927	245 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65

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