RNA–Protein interactions for RNA: YHR106W

TRR2, Transcript of Mitochondrial thioredoxin reductase, yeast

Gene TRR2, Length 1,029 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRR2	YHR106W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	YGL081W	P53156	320 aa		7.75	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	STP1	Q00947	519 aa		7.75	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	LCD1	Q04377	747 aa		7.75	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	YML083C	Q04526	418 aa		7.75	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	RAD59	Q12223	238 aa		7.75	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	GAL80	P04387	435 aa		7.74	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	GPA1	P08539	472 aa		7.74	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	OM45	P16547	393 aa		7.74	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	PEP7	P32609	515 aa		7.74	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	KDX1	P36005	433 aa		7.74	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	YBR284W	P38150	797 aa		7.74	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	RIM4	P38741	713 aa		7.74	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	YER130C	P39959	443 aa		7.74	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	TLG2	Q08144	397 aa		7.74	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	PLP2	Q12017	286 aa		7.74	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	VPS3	P23643	1011 aa		7.73	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	RAD27	P26793	382 aa		7.73	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	CTM1	P38818	585 aa		7.73	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	UBP5	P39944	805 aa		7.73	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	RSM25	P40496	264 aa		7.73	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	TOS3	P43637	560 aa		7.73	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	POL31	P46957	487 aa		7.73	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	SPC98	P53540	846 aa		7.73	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	TIM8	P57744	87 aa		7.73	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	ADA2	Q02336	434 aa		7.73	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	APM4	Q99186	491 aa		7.73	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	TPK1	P06244	397 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	CHS2	P14180	963 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	SCJ1	P25303	377 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	COQ8	P27697	501 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	GCS1	P35197	352 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	RDH54	P38086	958 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	PTC4	P38089	393 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	EFM2	P38347	419 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	MOB1	P40484	314 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	LSB6	P42951	607 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	7.72	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	COS5	P47187	383 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	NUT1	P53114	1132 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	YDR344C	Q05510	147 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	MLH2	Q07980	695 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	7.72	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	REC8	Q12188	680 aa		7.72	□□□□□ -1.17
TRR2	YHR106W	TAF13	P11747	167 aa		7.71	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	HMG2	P12684	1045 aa		7.71	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	7.71	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	SWI3	P32591	825 aa		7.71	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	SLA2	P33338	968 aa		7.71	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	YIR016W	P40572	265 aa		7.71	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	TAF1	P46677	1066 aa		7.71	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	STB4	P50104	949 aa		7.71	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	APE1	P14904	514 aa		7.7	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	PGS1	P25578	521 aa		7.7	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.7	□□□□□ -1.18	not detected
TRR2	YHR106W	PEX28	P38848	579 aa		7.7	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	MAF1	P41910	395 aa		7.7	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	SMC3	P47037	1230 aa		7.7	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	YGR237C	P50089	785 aa		7.7	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	APC11	Q12157	165 aa		7.7	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	CIT2	P08679	460 aa		7.69	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	MET4	P32389	672 aa		7.69	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	RGD1	P38339	666 aa		7.69	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	RRM3	P38766	723 aa		7.69	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	LSC2	P53312	427 aa		7.69	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	7.69	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	CDD1	Q06549	142 aa		7.69	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	AFT2	Q08957	416 aa		7.69	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	YPL216W	Q08964	1102 aa		7.69	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	YPR027C	Q12079	277 aa		7.69	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	SPE1	P08432	466 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	MAS1	P10507	462 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	CDC42	P19073	191 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	APL1	P27351	700 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	GSY2	P27472	705 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	MNR2	P35724	969 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
TRR2	YHR106W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	7.68	□□□□□ -1.18

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