RNA–Protein interactions for RNA: YHR038W

RRF1, Transcript of Mitochondrial ribosome recycling factor, yeast

Gene RRF1, Length 693 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRF1	YHR038W	MNR2	P35724	969 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	VBA5	P36172	582 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	RPN13	O13563	156 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	VPS34	P22543	875 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	PTP1	P25044	335 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	HIR1	P32479	840 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	RGT1	P32862	1170 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	STB2	P46679	850 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	UBC11	P52492	156 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	VPS16	Q03308	798 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	TGL5	Q12043	749 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RRF1	YHR038W	UBS1	P38290	277 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRF1	YHR038W	NDC80	P40460	691 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRF1	YHR038W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RRF1	YHR038W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRF1	YHR038W	HEM3	P28789	327 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRF1	YHR038W	SAK1	P38990	1142 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRF1	YHR038W	PZF1	P39933	429 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRF1	YHR038W	NET1	P47035	1189 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRF1	YHR038W	MPS1	P54199	764 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRF1	YHR038W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRF1	YHR038W	YLR415C	O13578	112 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRF1	YHR038W	TOK1	P40310	691 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RRF1	YHR038W	NGG1	P32494	702 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRF1	YHR038W	PAC2	P39937	518 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRF1	YHR038W	PFA3	P42836	336 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRF1	YHR038W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RRF1	YHR038W	YML020W	Q03722	664 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RRF1	YHR038W	SIT1	P39980	628 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRF1	YHR038W	XBP1	P40489	647 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRF1	YHR038W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RRF1	YHR038W	CIR2	Q08822	631 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RRF1	YHR038W	ERG11	P10614	530 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRF1	YHR038W	GLG1	P36143	616 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RRF1	YHR038W	BDH2	P39713	417 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRF1	YHR038W	SSY5	P47002	699 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRF1	YHR038W	YAP1802	P53309	568 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RRF1	YHR038W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	YKL069W	P36088	180 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	CTR1	P49573	406 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	SHE9	Q04172	456 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	REC104	P33323	182 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	LTP1	P40347	161 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.07	□□□□□ -1.76	not detected
RRF1	YHR038W	LCD1	Q04377	747 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.06	□□□□□ -1.76	not detected
RRF1	YHR038W	SIR3	P06701	978 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	REV7	P38927	245 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	BAP3	P41815	604 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	MEP2	P41948	499 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	NUP1	P20676	1076 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	SIC1	P38634	284 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	ARG2	P40360	574 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	PRI2	P20457	528 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.04	□□□□□ -1.76	not detected
RRF1	YHR038W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	GPR1	Q12361	961 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	SFB3	P38810	929 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	MRK1	P50873	501 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	OPI10	Q08202	246 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RRF1	YHR038W	SPC29	P33419	253 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RRF1	YHR038W	TPO2	P53283	614 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RRF1	YHR038W	GEP3	Q08622	556 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RRF1	YHR038W	ENV7	Q12003	364 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RRF1	YHR038W	MUP3	P38734	546 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RRF1	YHR038W	RSC3	Q06639	885 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RRF1	YHR038W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
RRF1	YHR038W	PRC1	P00729	532 aa		4	□□□□□ -1.77
RRF1	YHR038W	STE4	P18851	423 aa		4	□□□□□ -1.77
RRF1	YHR038W	YCL002C	P25565	263 aa		4	□□□□□ -1.77
RRF1	YHR038W	YBR284W	P38150	797 aa		4	□□□□□ -1.77
RRF1	YHR038W	PBY1	P38254	753 aa		4	□□□□□ -1.77
RRF1	YHR038W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
RRF1	YHR038W	TOP3	P13099	656 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RRF1	YHR038W	DAL7	P21826	554 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RRF1	YHR038W	MRP8	P35719	219 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RRF1	YHR038W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RRF1	YHR038W	CWC24	P53769	259 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RRF1	YHR038W	ATG4	P53867	494 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RRF1	YHR038W	GAD1	Q04792	585 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RRF1	YHR038W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RRF1	YHR038W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77

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