RNA–Protein interactions for RNA: YGR252W

GCN5, Transcript of Catalytic subunit of ADA and SAGA histone acetyltransferase complexes, yeast

Gene GCN5, Length 1,320 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GCN5	YGR252W	OSW2	Q12202	724 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCN5	YGR252W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GCN5	YGR252W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN5	YGR252W	ADE8	P04161	214 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN5	YGR252W	PPH3	P32345	308 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN5	YGR252W	RPC82	P32349	654 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN5	YGR252W	OPY1	P38271	328 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN5	YGR252W	YBR184W	P38299	523 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN5	YGR252W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GCN5	YGR252W	MTC3	P53077	123 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN5	YGR252W	ERP6	P53198	216 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN5	YGR252W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GCN5	YGR252W	MDM38	Q08179	573 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN5	YGR252W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN5	YGR252W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GCN5	YGR252W	RAV1	P47104	1357 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN5	YGR252W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GCN5	YGR252W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GCN5	YGR252W	FUN30	P31380	1131 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCN5	YGR252W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GCN5	YGR252W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GCN5	YGR252W	SRP101	P32916	621 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCN5	YGR252W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GCN5	YGR252W	SIT1	P39980	628 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCN5	YGR252W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GCN5	YGR252W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCN5	YGR252W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCN5	YGR252W	TY1B-H	O13535	1793 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	TY1B-LR2	P0C2I5	1755 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	TY1B-LR3	P0C2I6	1755 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	TY1B-PR1	P0C2I9	1755 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	TY1B-PR2	P0C2J0	1756 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	TY1B-PR3	P0C2J1	1755 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	TY1B-JR1	P47098	1755 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	TY1B-ML2	Q03434	1755 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	LTE1	P07866	1435 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	STE5	P32917	917 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	SDS3	P40505	327 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	SRT1	Q03175	343 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	EAF1	Q06337	982 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	YSP2	Q06681	1438 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	YDL144C	Q07589	356 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	FMP25	Q08023	583 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	RAD4	P14736	754 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	ATG19	P35193	415 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	YKL151C	P36059	337 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	YIR014W	P40570	242 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	TCB2	P48231	1178 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	IOC4	Q04213	475 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	PDR12	Q02785	1511 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	ALG7	P07286	448 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
GCN5	YGR252W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	GYP7	P48365	746 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	IMO32	P53219	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
GCN5	YGR252W	HSF1	P10961	833 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	ARE1	P25628	610 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	GIC1	P38785	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	ALR2	P43553	858 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	PFD1	P46988	109 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	TIM54	P47045	478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	COQ11	Q05892	277 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	DRS2	P39524	1355 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	BNR1	P40450	1375 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	SPE2	P21182	396 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	TMT1	P32643	299 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	HUL4	P40985	892 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	LCD1	Q04377	747 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	TRM13	Q12383	476 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	ROX1	P25042	368 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	PPZ2	P33329	710 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	YRO2	P38079	344 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	OCA5	P38738	679 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	NSE3	Q05541	303 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	SUT2	Q12286	268 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCN5	YGR252W	CIT1	P00890	479 aa		4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 28.3 ms