RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 NBPF14Q5TI25 921 aa10.35□□□□□ -0.75
GINS1-201ENST00000262460 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
GINS1-201ENST00000262460 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa10.35□□□□□ -0.75
GINS1-201ENST00000262460 NBPF15Q8N660 670 aa10.35□□□□□ -0.75
GINS1-201ENST00000262460 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
GINS1-201ENST00000262460 ANKARQ7Z5J8 1434 aa10.35□□□□□ -0.75
GINS1-201ENST00000262460 RGPD5Q99666 1765 aa10.35□□□□□ -0.75
GINS1-201ENST00000262460 LUZP1Q86V48 1076 aa10.35□□□□□ -0.75
GINS1-201ENST00000262460 STK11IPQ8N1F8 1099 aa10.35□□□□□ -0.75
GINS1-201ENST00000262460 RUFY2Q8WXA3 655 aa10.35□□□□□ -0.75
GINS1-201ENST00000262460 BRF1Q92994 677 aa10.35□□□□□ -0.75
GINS1-201ENST00000262460 TTC41PQ6P2S7 1318 aa10.35□□□□□ -0.75
GINS1-201ENST00000262460 ALDH1L1O75891 902 aa10.35□□□□□ -0.75
GINS1-201ENST00000262460 MAP4K1Q92918 833 aa10.35□□□□□ -0.75
GINS1-201ENST00000262460 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
GINS1-201ENST00000262460 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
GINS1-201ENST00000262460 MEGF6O75095 1541 aa10.35□□□□□ -0.75
GINS1-201ENST00000262460 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa10.34□□□□□ -0.75
GINS1-201ENST00000262460 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP10.34□□□□□ -0.75
GINS1-201ENST00000262460 TNNI3KQ59H18 835 aa10.34□□□□□ -0.75
GINS1-201ENST00000262460 STOX1Q6ZVD7 989 aa10.34□□□□□ -0.75
GINS1-201ENST00000262460 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa10.34□□□□□ -0.75
GINS1-201ENST00000262460 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa10.34□□□□□ -0.75
GINS1-201ENST00000262460 TAF5LO75529 589 aa10.34□□□□□ -0.75
GINS1-201ENST00000262460 Q6ZUG5 572 aa10.34□□□□□ -0.75
GINS1-201ENST00000262460 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
GINS1-201ENST00000262460 DENND2AQ9ULE3 1009 aa10.34□□□□□ -0.75
GINS1-201ENST00000262460 AOX1Q06278 1338 aa10.34□□□□□ -0.75
GINS1-201ENST00000262460 CYP21A2P08686 494 aa10.33□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 ATF3P18847 181 aa10.33□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 APOBRQ0VD83 1088 aa10.33□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 MTX1Q13505 466 aa10.33□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 UQCRHLA0A096LP55 91 aa10.33□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 SNAP23O00161 211 aa10.33□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 OFD1O75665 1012 aa10.33□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 UQCRHP07919 91 aa10.33□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 GPTP24298 496 aa10.33□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 CCDC183Q5T5S1 534 aa10.33□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 BABAM1Q9NWV8 329 aa10.33□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 DACT1Q9NYF0 836 aa10.33□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa10.33□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 VSIG10Q8N0Z9 540 aa10.33□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa10.33□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 HOXB7P09629 217 aa10.32□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 ADORA1P30542 326 aa10.32□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 NRBP1Q9UHY1 535 aa10.32□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 RPS6KB1P23443 525 aa10.32□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 UBE2HP62256 183 aa10.32□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 NKX2-3Q8TAU0 364 aa10.32□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 FAM89AQ96GI7 184 aa10.32□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 ZNF609O15014 1411 aa10.31□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 NR1I2O75469 434 aa10.31□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 LRP10Q7Z4F1 713 aa10.31□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 ERC1Q8IUD2 1116 aa10.31□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 IFNL2Q8IZJ0 200 aa10.31□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 PYCARDQ9ULZ3 195 aa10.31□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 RXRAP19793 462 aa10.31□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 LRMPQ12912 555 aa10.31□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 PXDNLA1KZ92 1463 aa10.31□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 SCARF1Q14162 830 aa10.31□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 BICD2Q8TD16 824 aa10.31□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 INCENPQ9NQS7 918 aa10.31□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 SPATA32Q96LK8 384 aa10.3□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 TMEM94Q12767 1356 aa10.3□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa10.3□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 SCRN1Q12765 414 aa10.3□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 PGBD1Q96JS3 809 aa10.3□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 FMNL2Q96PY5 1086 aa10.3□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 C19orf44Q9H6X5 657 aa10.3□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 PRDM11Q9NQV5 511 aa10.3□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 HEG1Q9ULI3 1381 aa10.3□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 PTPN21Q16825 1174 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 ISM2Q6H9L7 571 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 NEK1Q96PY6 1258 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 CCDC39Q9UFE4 941 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 H3BQV1 296 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 ARID5BQ14865 1188 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 ANO6Q4KMQ2 910 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 IFFO2Q5TF58 517 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 DNAJC25Q9H1X3 360 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 PTGS1P23219 599 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 WASHC4Q2M389 1173 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 KCNF1Q9H3M0 494 aa10.29□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 UBE2Q2LH0YL09 131 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 M0R2C6 588 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 FOXO4P98177 505 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 KDM3BQ7LBC6 1761 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 ATG9AQ7Z3C6 839 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 C1orf167Q5SNV9 1468 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 DRC7Q8IY82 874 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 PRDM10Q9NQV6 1147 aa10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms