RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Efcab2Q9CQ46 164 aa26.17■■□□□ 1.78
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tbc1d4Q8BYJ6 1307 aa26.17■■□□□ 1.78
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa26.16■■□□□ 1.78
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Irgm2A0A140LIF8 407 aa26.16■■□□□ 1.78
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gnat3Q3V3I2 354 aa26.16■■□□□ 1.78
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Iffo2Q8R2V2 512 aa26.16■■□□□ 1.78
Trafd1-201ENSMUST00000042312 FosbP13346 338 aa26.16■■□□□ 1.78
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc162pQ0VG85 912 aa26.16■■□□□ 1.78
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lins1Q3U1D0 764 aa26.16■■□□□ 1.78
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atp8b3Q6UQ17 1335 aa26.16■■□□□ 1.78
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zkscan7E9PVW1 718 aa26.15■■□□□ 1.78
Trafd1-201ENSMUST00000042312 EzrP26040 586 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Col4a1P02463 1669 aa26.14■■□□□ 1.78
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tyro3P55144 880 aa26.14■■□□□ 1.78
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Irf5P56477 497 aa26.14■■□□□ 1.78
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kcnf1Q7TSH7 493 aa26.14■■□□□ 1.78
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ano1Q8BHY3 960 aa26.14■■□□□ 1.78
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mb21d2Q8C525 428 aa26.14■■□□□ 1.78
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prl7a2O54831 253 aa26.14■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ankle2Q6P1H6 964 aa26.14■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ddx58Q6Q899 926 aa26.14■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ppp1r10Q80W00 888 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rrs1Q9CYH6 365 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Syde2E9PUP1 1314 aa26.13■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ppfia3P60469 1194 aa26.13■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Timm10P62073 90 aa26.13■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc129Q14B48 1034 aa26.13■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 RgmbQ7TQ33 436 aa26.13■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rassf8Q8CJ96 419 aa26.13■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam84aQ9D650 292 aa26.13■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 TnmdQ9EP64 317 aa26.13■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Krt85Q9Z2T6 507 aa26.13■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa26.12■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm7361D3Z6R1 267 aa26.12■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa26.12■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm1979E9QAN3 267 aa26.12■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm5862K7N5V5 267 aa26.12■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10220K7N660 267 aa26.12■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ncbp1Q3UYV9 790 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cavin1O54724 392 aa26.12■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Usp44Q8C2S0 711 aa26.12■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa26.12■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mctp1E9PV86 951 aa26.11■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sult6b1P0CC03 303 aa26.11■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ptgs1P22437 602 aa26.11■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cyp2d10P24456 504 aa26.11■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Golim4Q8BXA1 655 aa26.11■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ptcd1Q8C2E4 695 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Srgap1Q91Z69 1062 aa26.11■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sh3bp5Q9Z131 463 aa26.11■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zfp317Q8C0Q5 607 aa26.11■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lmbrd2Q8C561 694 aa26.11■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Bmp2kQ91Z96 1138 aa26.11■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Speer4bQ9D9F7 267 aa26.11■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kansl3A2RSY1 903 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Wdr78E9PYY5 807 aa26.1■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ifit1Q64282 463 aa26.1■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Inpp5bQ8K337 993 aa26.1■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa26.1■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Oxsr1Q6P9R2 527 aa26.1■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zbtb40Q6PCS8 1258 aa26.1■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Wnk3Q80XP9 1757 aa26.09■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atg9aQ68FE2 551 aa26.09■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc5a1Q8C3K6 665 aa26.09■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc158Q8CDI6 1109 aa26.09■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Bicd2Q921C5 820 aa26.09■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ssfa2Q922B9 1252 aa26.09■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hmx1O70218 332 aa26.08■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 TrhQ62361 256 aa26.08■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Flad1Q8R123 492 aa26.08■■□□□ 1.77
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prl3d3A0A0M6L0J6 224 aa26.08■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nlrp1aQ2LKU9 1182 aa26.08■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rps6ka5Q8C050 863 aa26.08■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 1700113H08RikE9Q9Q5 327 aa26.07■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ltv1Q6NSQ7 470 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Serpina10Q8R121 448 aa26.07■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ercc3P49135 783 aa26.07■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CebpzP53569 1052 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cfap157Q0VFX2 523 aa26.07■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ttc27Q8CD92 847 aa26.07■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tubb6Q922F4 447 aa26.07■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Klhl34A2AI76 644 aa26.06■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cct2P80314 535 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Chmp3Q9CQ10 224 aa26.06■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slit1Q80TR4 1531 aa26.06■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Usp28Q5I043 1051 aa26.06■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atf3Q60765 181 aa26.06■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NfkbibQ60778 359 aa26.06■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ppp4r3aQ6P2K6 820 aa26.06■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmc2Q8R4P4 888 aa26.06■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ank1Q02357 1862 aa26.05■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trim52Q8CDV4 233 aa26.05■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 FocadA2AKG8 1798 aa26.05■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Csrnp1P59054 583 aa26.05■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fbxl16A2RT62 479 aa26.04■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Erc1Q99MI1 1120 aa26.04■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sh3bgrQ9WUZ7 214 aa26.04■■□□□ 1.76
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ric1Q69ZJ7 1422 aa26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 370.6 ms