Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44,67■■■■■ 4,74
Atp8b3Q6UQ17 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41,26■■■■■ 4,2
Atp8b3Q6UQ17 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,67■■■■■ 4,1
Atp8b3Q6UQ17 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,06■■■■■ 4
Atp8b3Q6UQ17 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39,16■■■■□ 3,86
Atp8b3Q6UQ17 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,76■■■■□ 3,79
Atp8b3Q6UQ17 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,69■■■■□ 3,78
Atp8b3Q6UQ17 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38,68■■■■□ 3,78
Atp8b3Q6UQ17 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38,33■■■■□ 3,73
Atp8b3Q6UQ17 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,9■■■■□ 3,66
Atp8b3Q6UQ17 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,69■■■■□ 3,62
Atp8b3Q6UQ17 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37,45■■■■□ 3,59
Atp8b3Q6UQ17 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37,41■■■■□ 3,58
Atp8b3Q6UQ17 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37,32■■■■□ 3,56
Atp8b3Q6UQ17 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,12■■■■□ 3,53
Atp8b3Q6UQ17 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
Atp8b3Q6UQ17 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,5■■■■□ 3,43
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,49■■■■□ 3,43
Atp8b3Q6UQ17 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,39■■■■□ 3,42
Atp8b3Q6UQ17 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36,38■■■■□ 3,41
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Atp8b3Q6UQ17 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,2■■■■□ 3,39
Atp8b3Q6UQ17 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36,08■■■■□ 3,37
Atp8b3Q6UQ17 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,07■■■■□ 3,37
Atp8b3Q6UQ17 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35,99■■■■□ 3,35
Atp8b3Q6UQ17 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,94■■■■□ 3,34
Atp8b3Q6UQ17 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Atp8b3Q6UQ17 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Atp8b3Q6UQ17 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Atp8b3Q6UQ17 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Atp8b3Q6UQ17 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35,81■■■■□ 3,32
Atp8b3Q6UQ17 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
Atp8b3Q6UQ17 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
Atp8b3Q6UQ17 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35,63■■■■□ 3,29
Atp8b3Q6UQ17 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,58■■■■□ 3,29
Atp8b3Q6UQ17 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
Atp8b3Q6UQ17 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
Atp8b3Q6UQ17 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Atp8b3Q6UQ17 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Atp8b3Q6UQ17 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,25■■■■□ 3,23
Atp8b3Q6UQ17 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35,22■■■■□ 3,23
Atp8b3Q6UQ17 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35,18■■■■□ 3,22
Atp8b3Q6UQ17 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
Atp8b3Q6UQ17 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34,98■■■■□ 3,19
Atp8b3Q6UQ17 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,96■■■■□ 3,19
Atp8b3Q6UQ17 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Atp8b3Q6UQ17 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Atp8b3Q6UQ17 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
Atp8b3Q6UQ17 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34,56■■■■□ 3,12
Atp8b3Q6UQ17 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,55■■■■□ 3,12
Atp8b3Q6UQ17 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,55■■■■□ 3,12
Atp8b3Q6UQ17 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34,44■■■■□ 3,1
Atp8b3Q6UQ17 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Atp8b3Q6UQ17 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34,36■■■■□ 3,09
Atp8b3Q6UQ17 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Atp8b3Q6UQ17 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Atp8b3Q6UQ17 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Atp8b3Q6UQ17 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34,32■■■■□ 3,09
Atp8b3Q6UQ17 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34,29■■■■□ 3,08
Atp8b3Q6UQ17 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,07
Atp8b3Q6UQ17 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34,16■■■■□ 3,06
Atp8b3Q6UQ17 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34,06■■■■□ 3,04
Atp8b3Q6UQ17 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,06■■■■□ 3,04
Atp8b3Q6UQ17 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Atp8b3Q6UQ17 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33,99■■■■□ 3,03
Atp8b3Q6UQ17 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Atp8b3Q6UQ17 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33,87■■■■□ 3,01
Atp8b3Q6UQ17 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Atp8b3Q6UQ17 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Atp8b3Q6UQ17 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33,66■■■□□ 2,98
Atp8b3Q6UQ17 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Atp8b3Q6UQ17 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,64■■■□□ 2,98
Atp8b3Q6UQ17 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33,63■■■□□ 2,97
Atp8b3Q6UQ17 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Atp8b3Q6UQ17 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Atp8b3Q6UQ17 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33,51■■■□□ 2,95
Atp8b3Q6UQ17 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Atp8b3Q6UQ17 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Atp8b3Q6UQ17 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33,42■■■□□ 2,94
Atp8b3Q6UQ17 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33,41■■■□□ 2,94
Atp8b3Q6UQ17 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33,36■■■□□ 2,93
Atp8b3Q6UQ17 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,93
Atp8b3Q6UQ17 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Atp8b3Q6UQ17 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Atp8b3Q6UQ17 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Atp8b3Q6UQ17 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Atp8b3Q6UQ17 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33,23■■■□□ 2,91
Atp8b3Q6UQ17 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33,23■■■□□ 2,91
Atp8b3Q6UQ17 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33,19■■■□□ 2,9
Atp8b3Q6UQ17 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Atp8b3Q6UQ17 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Atp8b3Q6UQ17 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33,14■■■□□ 2,9
Atp8b3Q6UQ17 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33,12■■■□□ 2,89
Atp8b3Q6UQ17 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Atp8b3Q6UQ17 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,09■■■□□ 2,89
Atp8b3Q6UQ17 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Atp8b3Q6UQ17 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,04■■■□□ 2,88
Atp8b3Q6UQ17 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Atp8b3Q6UQ17 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33,01■■■□□ 2,87
Atp8b3Q6UQ17 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32,99■■■□□ 2,87
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