Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.67■■■■■ 4.74
Atp8b3Q6UQ17 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Atp8b3Q6UQ17 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Atp8b3Q6UQ17 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Atp8b3Q6UQ17 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
Atp8b3Q6UQ17 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
Atp8b3Q6UQ17 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Atp8b3Q6UQ17 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
Atp8b3Q6UQ17 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
Atp8b3Q6UQ17 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Atp8b3Q6UQ17 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Atp8b3Q6UQ17 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Atp8b3Q6UQ17 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Atp8b3Q6UQ17 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
Atp8b3Q6UQ17 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Atp8b3Q6UQ17 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Atp8b3Q6UQ17 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Atp8b3Q6UQ17 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Atp8b3Q6UQ17 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Atp8b3Q6UQ17 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Atp8b3Q6UQ17 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Atp8b3Q6UQ17 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Atp8b3Q6UQ17 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Atp8b3Q6UQ17 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Atp8b3Q6UQ17 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Atp8b3Q6UQ17 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Atp8b3Q6UQ17 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Atp8b3Q6UQ17 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Atp8b3Q6UQ17 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Atp8b3Q6UQ17 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Atp8b3Q6UQ17 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Atp8b3Q6UQ17 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Atp8b3Q6UQ17 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Atp8b3Q6UQ17 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Atp8b3Q6UQ17 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Atp8b3Q6UQ17 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Atp8b3Q6UQ17 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Atp8b3Q6UQ17 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Atp8b3Q6UQ17 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Atp8b3Q6UQ17 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Atp8b3Q6UQ17 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Atp8b3Q6UQ17 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Atp8b3Q6UQ17 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Atp8b3Q6UQ17 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Atp8b3Q6UQ17 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Atp8b3Q6UQ17 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Atp8b3Q6UQ17 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Atp8b3Q6UQ17 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Atp8b3Q6UQ17 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Atp8b3Q6UQ17 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Atp8b3Q6UQ17 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Atp8b3Q6UQ17 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Atp8b3Q6UQ17 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Atp8b3Q6UQ17 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Atp8b3Q6UQ17 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Atp8b3Q6UQ17 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.32■■■■□ 3.09
Atp8b3Q6UQ17 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Atp8b3Q6UQ17 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Atp8b3Q6UQ17 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Atp8b3Q6UQ17 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Atp8b3Q6UQ17 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Atp8b3Q6UQ17 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Atp8b3Q6UQ17 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Atp8b3Q6UQ17 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Atp8b3Q6UQ17 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Atp8b3Q6UQ17 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Atp8b3Q6UQ17 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Atp8b3Q6UQ17 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Atp8b3Q6UQ17 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Atp8b3Q6UQ17 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Atp8b3Q6UQ17 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Atp8b3Q6UQ17 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Atp8b3Q6UQ17 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Atp8b3Q6UQ17 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Atp8b3Q6UQ17 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Atp8b3Q6UQ17 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Atp8b3Q6UQ17 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Atp8b3Q6UQ17 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Atp8b3Q6UQ17 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Atp8b3Q6UQ17 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Atp8b3Q6UQ17 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Atp8b3Q6UQ17 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Atp8b3Q6UQ17 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Atp8b3Q6UQ17 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Atp8b3Q6UQ17 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Atp8b3Q6UQ17 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Atp8b3Q6UQ17 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Atp8b3Q6UQ17 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Atp8b3Q6UQ17 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Atp8b3Q6UQ17 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Atp8b3Q6UQ17 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Atp8b3Q6UQ17 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Atp8b3Q6UQ17 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Atp8b3Q6UQ17 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Atp8b3Q6UQ17 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Atp8b3Q6UQ17 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Atp8b3Q6UQ17 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms