RNA–Protein interactions for RNA: YLR117C

CLF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene CLF1, Length 2,064 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLF1	YLR117C	MRPS35	P53292	345 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	COS6	P53344	381 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	NCA2	Q12374	616 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	RSF2	P46974	1380 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	APC1	P53886	1748 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	SPO12	P17123	173 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	HSP30	P25619	332 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	APD1	P38281	316 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	IFA38	P38286	347 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	UBP12	P39538	1254 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	BUD6	P41697	788 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	COA4	Q05809	96 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	YLR287C	Q05881	355 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	YLR001C	Q07895	862 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	YOL057W	Q08225	711 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	UIP4	Q08926	304 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	AFT2	Q08957	416 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	RKM4	Q12504	494 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	LAM4	P38800	1345 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	PDE2	P06776	526 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	SEC2	P17065	759 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	APL1	P27351	700 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	PEP7	P32609	515 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	SMC1	P32908	1225 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	NIP100	P33420	868 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	YET1	P35723	206 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	RTS1	P38903	757 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	GCD10	P41814	478 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	YJR054W	P47114	497 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	YKE2	P52553	114 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	GDE1	Q02979	1223 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	URH1	Q04179	340 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	GTB1	Q04924	702 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	YLR407W	Q06070	228 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	RSC2	Q06488	889 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	ARR2	Q06597	130 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	PCL8	Q08966	492 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	YLR125W	Q12138	136 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	SPO21	Q12411	609 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	NMT1	P14743	455 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	MSM1	P22438	575 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	PHO3	P24031	467 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	TSR4	P25040	408 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	SPS22	P25380	463 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	CTM1	P38818	585 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	ALG2	P43636	503 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	GCV2	P49095	1034 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	MRM2	P53123	320 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	DCS1	Q06151	350 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	SEC10	Q06245	871 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	PIB1	Q06651	286 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	SYO1	Q07395	620 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	SOG2	Q08817	791 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	TUS1	Q06412	1307 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	SEC63	P14906	663 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	RGP1	P16664	663 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	SPO11	P23179	398 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.04	□□□□□ -1.6	not detected
CLF1	YLR117C	RAM2	P29703	316 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	MRX3	P38172	270 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	SNL1	P40548	159 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	PHB1	P40961	287 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	ULP1	Q02724	621 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CLF1	YLR117C	DON1	Q05610	365 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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