RNA–Protein interactions for RNA: YKL011C

CCE1, Transcript of Mitochondrial cruciform cutting endonuclease, yeast

Gene CCE1, Length 1,062 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CCE1	YKL011C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	AFT2	Q08957	416 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	CIT1	P00890	479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	ALR2	P43553	858 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	OSW7	P43611	510 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	RNH70	P53331	553 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	UBX5	Q06682	500 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	SRP101	P32916	621 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	RNT1	Q02555	471 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	OSW2	Q12202	724 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	MDM10	P18409	493 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	PPG1	P32838	368 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	YDR306C	Q06640	478 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	TRM13	Q12383	476 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	GAL11	P19659	1081 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	TIM23	P32897	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	CCC2	P38995	1004 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	NUP82	P40368	713 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	HUL4	P40985	892 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	YAP7	Q08182	245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
CCE1	YKL011C	CAN1	P04817	590 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	SDS3	P40505	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
CCE1	YKL011C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	TAF8	Q03750	510 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	ICT1	Q12385	394 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCE1	YKL011C	ERR1	P0CX10	437 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	ERR2	P0CX11	437 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	PPH3	P32345	308 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	TPO2	P53283	614 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	HOF1	Q05080	669 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	SUT2	Q12286	268 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	BNR1	P40450	1375 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	ALG7	P07286	448 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	HSF1	P10961	833 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	PHO8	P11491	566 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	CDC11	P32458	415 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	YKL151C	P36059	337 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	YBR284W	P38150	797 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	RTA1	P53047	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	ALG12	P53730	551 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	BET3	P36149	193 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	ADE8	P04161	214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	TOP3	P13099	656 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	ATG19	P35193	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	YRO2	P38079	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	SIT1	P39980	628 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	IMO32	P53219	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	YLR125W	Q12138	136 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	YPR071W	Q12346	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	THI4	P32318	326 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	BRN1	P38170	754 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	COQ11	Q05892	277 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	TMT1	P32643	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	MDM38	Q08179	573 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	UPC2	Q12151	913 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	NPP1	P25353	742 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	AFR1	P33304	620 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	PET10	P36139	283 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	ERT1	P38140	529 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	ERG5	P54781	538 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	LCD1	Q04377	747 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCE1	YKL011C	SCT1	P32784	759 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCE1	YKL011C	PPZ2	P33329	710 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCE1	YKL011C	GIC1	P38785	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCE1	YKL011C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CCE1	YKL011C	TOK1	P40310	691 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCE1	YKL011C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CCE1	YKL011C	DOS2	P54858	310 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCE1	YKL011C	SRT1	Q03175	343 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCE1	YKL011C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64

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