RNA–Protein interactions for RNA: YJL007C

YJL007C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJL007C, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL007C	YJL007C	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YJL007C	YJL007C	SDP1	P40479	209 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJL007C	YJL007C	PFD1	P46988	109 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJL007C	YJL007C	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YJL007C	YJL007C	TPO2	P53283	614 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJL007C	YJL007C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YJL007C	YJL007C	UBX5	Q06682	500 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJL007C	YJL007C	ALG7	P07286	448 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJL007C	YJL007C	FBP1	P09201	348 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJL007C	YJL007C	REC104	P33323	182 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJL007C	YJL007C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YJL007C	YJL007C	HDA1	P53973	706 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJL007C	YJL007C	ERG5	P54781	538 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJL007C	YJL007C	MUK1	Q02866	612 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJL007C	YJL007C	LCD1	Q04377	747 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJL007C	YJL007C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	YPT53	P36019	220 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
YJL007C	YJL007C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	RNT1	Q02555	471 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	TMN2	Q04562	672 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	FMP25	Q08023	583 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	MCH5	Q08777	521 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	SWM1	Q12379	170 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	EAF1	Q06337	982 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	ACF2	Q12168	779 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	CDC11	P32458	415 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	CTF13	P35203	478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	CTF8	P38877	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	PUS2	P53167	370 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	YML122C	Q03207	126 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	ARE1	P25628	610 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	FKH2	P41813	862 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	FRE5	Q08908	694 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	TOP3	P13099	656 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	PPS1	P38148	807 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	RPP1	P38786	293 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	YHR078W	P38799	552 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	VHR1	P40522	640 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	MRPS35	P53292	345 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	OMS1	Q06668	471 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	SPO75	Q07798	868 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	TRM11	Q12463	433 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJL007C	YJL007C	PET10	P36139	283 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	ELO3	P40319	345 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	GND2	P53319	492 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	DLT1	Q04216	342 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	ENV7	Q12003	364 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	MET3	P08536	511 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	MPH2	P0CD99	609 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	STU2	P46675	888 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	ERP6	P53198	216 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	RAD4	P14736	754 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	DAL7	P21826	554 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	MTH1	P35198	433 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	SPC42	P36094	363 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	MUP1	P50276	574 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	TIM44	Q01852	431 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	OSH2	Q12451	1283 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	YCL002C	P25565	263 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.49	□□□□□ -1.69	not detected
YJL007C	YJL007C	IRC10	Q08118	586 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	SAK1	P38990	1142 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	NIT3	P49954	291 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	PKH1	Q03407	766 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	PRC1	P00729	532 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	PZF1	P39933	429 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	TIM54	P47045	478 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	TAD1	P53065	400 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	ASI2	P53895	289 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	CRR1	Q05790	422 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	ADY4	Q05955	493 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YJL007C	YJL007C	CIT1	P00890	479 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YJL007C	YJL007C	SAP190	P36123	1033 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YJL007C	YJL007C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7

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