RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000139005.1

Hoxd3os1-202, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd3os1, Length 1,701 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Kdm4aQ8BW72 1064 aa15.51■□□□□ 0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Bag4Q8CI61 457 aa15.51■□□□□ 0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ubn2Q80WC1 1314 aa15.51■□□□□ 0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Cyp2c69E9PXC3 491 aa15.5■□□□□ 0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Cyp2c40P56657 491 aa15.5■□□□□ 0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Gpr162Q3UN16 588 aa15.5■□□□□ 0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Flad1Q8R123 492 aa15.5■□□□□ 0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Gtpbp4Q99ME9 634 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Swt1Q9DBQ9 907 aa15.5■□□□□ 0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ccdc173A0JLY1 547 aa15.49■□□□□ 0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Tgfb2P27090 414 aa15.49■□□□□ 0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa15.49■□□□□ 0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Casq1O09165 405 aa15.48■□□□□ 0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Fez2Q6TYB5 348 aa15.48■□□□□ 0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 4931400O07RikQ9D4M5 137 aa15.48■□□□□ 0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Fkbp4P30416 458 aa15.48■□□□□ 0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 EgfrQ01279 1210 aa15.48■□□□□ 0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Anp32cQ64G17 123 aa15.48■□□□□ 0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1700010I14RikQ7TPG0 532 aa15.48■□□□□ 0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Fam13bQ8K2H3 851 aa15.48■□□□□ 0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Dpf1Q9QX66 387 aa15.48■□□□□ 0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa15.46■□□□□ 0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Esco1Q69Z69 843 aa15.46■□□□□ 0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 GckrQ91X44 587 aa15.46■□□□□ 0.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Dync1i1O88485 628 aa15.46■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Igfbp6P47880 238 aa15.46■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Snai1Q02085 264 aa15.46■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Chpf2Q3UU43 768 aa15.46■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Neurod2Q62414 383 aa15.46■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Zfp251Q6PCX8 632 aa15.46■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Mtcl1Q3UHU5 1945 aa15.45■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Rcan3Q9JKK0 239 aa15.45■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Klrk1O54709 232 aa15.44■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Adam1aQ60813 791 aa15.44■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Rbm26Q6NZN0 1012 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 IarsQ8BU30 1262 aa15.44■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Inpp5bQ8K337 993 aa15.44■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Kif18aQ91WD7 886 aa15.44■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ssc5dQ8BV57 1371 aa15.43■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Rfx1P48377 963 aa15.43■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Wdhd1P59328 1117 aa15.43■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Gja5Q01231 358 aa15.43■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Rapgefl1Q68EF8 662 aa15.43■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Slf2Q6P9P0 1278 aa15.43■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 B4galnt4Q766D5 1034 aa15.43■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Adam1bQ8R534 806 aa15.43■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Irx4Q9QY61 515 aa15.43■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Taf7Q9R1C0 341 aa15.43■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Cfap70D3YVL2 1141 aa15.43■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Yy1Q00899 414 aa15.43■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ncbp1Q3UYV9 790 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Q8C6G1 249 aa15.43■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 FktnQ8R507 461 aa15.43■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Pank2Q3U4S0 443 aa15.42■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Zkscan1Q8BGS3 561 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Bloc1s4Q8VED2 215 aa15.42■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Atxn3Q9CVD2 355 aa15.42■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Fam114a1Q9D281 569 aa15.42■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ankrd31A0A140LI88 1765 aa15.42■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Zscan25B2RX31 543 aa15.41■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Wwc1Q5SXA9 1104 aa15.41■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 SkilQ60665 675 aa15.41■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 TrhQ62361 256 aa15.41■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Arid3aQ62431 601 aa15.41■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ercc6lQ8BHK9 1240 aa15.41■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Cetn4Q8K4K1 168 aa15.41■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 BcorQ8CGN4 1759 aa15.41■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Megf6Q80V70 1572 aa15.41■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Hspa2P17156 633 aa15.4■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Cers3Q1A3B0 383 aa15.4■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 SympkQ80X82 1284 aa15.4■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Cyp2c23E9Q5K4 494 aa15.4■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Pnmal2G3X9N3 661 aa15.4■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Lmnb1P14733 588 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Nedd4P46935 887 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ifit1bl2Q3U687 466 aa15.4■□□□□ 0.06
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Map7d2A2AG50 781 aa15.39■□□□□ 0.05
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 CastP51125 788 aa15.39■□□□□ 0.05
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Prdm11A2AGX3 565 aa15.38■□□□□ 0.05
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ttll7A4Q9F0 912 aa15.38■□□□□ 0.05
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Cyp2c68K7N6C2 491 aa15.38■□□□□ 0.05
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Cbx1P83917 185 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 SowahdQ8BY98 327 aa15.38■□□□□ 0.05
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa15.38■□□□□ 0.05
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 NgdnQ9DB96 315 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Tango6Q8C3S2 1079 aa15.37■□□□□ 0.05
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Trim52Q8CDV4 233 aa15.37■□□□□ 0.05
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ambra1A2AH22 1300 aa15.37■□□□□ 0.05
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 SnrkQ8VDU5 748 aa15.37■□□□□ 0.05
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Duox1A2AQ92 1551 aa15.37■□□□□ 0.05
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Fam184aE9PW83 1143 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Rasa1E9PYG6 1038 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Akap2O54931 893 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 EzrP26040 586 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Atp2b3Q0VF55 1220 aa15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.8 ms