Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Irx4Q9QY61 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Irx4Q9QY61 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Irx4Q9QY61 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Irx4Q9QY61 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Irx4Q9QY61 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Irx4Q9QY61 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Irx4Q9QY61 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Irx4Q9QY61 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Irx4Q9QY61 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Irx4Q9QY61 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Irx4Q9QY61 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Irx4Q9QY61 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Irx4Q9QY61 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Irx4Q9QY61 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Irx4Q9QY61 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Irx4Q9QY61 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Irx4Q9QY61 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Irx4Q9QY61 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Irx4Q9QY61 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Irx4Q9QY61 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Irx4Q9QY61 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Irx4Q9QY61 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Irx4Q9QY61 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Irx4Q9QY61 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Irx4Q9QY61 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Irx4Q9QY61 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Irx4Q9QY61 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Irx4Q9QY61 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Irx4Q9QY61 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Irx4Q9QY61 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Irx4Q9QY61 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Irx4Q9QY61 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Irx4Q9QY61 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Irx4Q9QY61 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Irx4Q9QY61 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Irx4Q9QY61 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Irx4Q9QY61 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Irx4Q9QY61 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Irx4Q9QY61 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Irx4Q9QY61 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Irx4Q9QY61 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Irx4Q9QY61 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Irx4Q9QY61 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Irx4Q9QY61 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Irx4Q9QY61 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Irx4Q9QY61 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Irx4Q9QY61 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Irx4Q9QY61 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Irx4Q9QY61 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Irx4Q9QY61 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Irx4Q9QY61 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Irx4Q9QY61 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Irx4Q9QY61 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Irx4Q9QY61 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Irx4Q9QY61 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Irx4Q9QY61 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.57
Irx4Q9QY61 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Irx4Q9QY61 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Irx4Q9QY61 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Irx4Q9QY61 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Irx4Q9QY61 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Irx4Q9QY61 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Irx4Q9QY61 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Irx4Q9QY61 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Irx4Q9QY61 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Irx4Q9QY61 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Irx4Q9QY61 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Irx4Q9QY61 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Irx4Q9QY61 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Irx4Q9QY61 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Irx4Q9QY61 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Irx4Q9QY61 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Irx4Q9QY61 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Irx4Q9QY61 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Irx4Q9QY61 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Irx4Q9QY61 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Irx4Q9QY61 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Irx4Q9QY61 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Irx4Q9QY61 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Irx4Q9QY61 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Irx4Q9QY61 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Irx4Q9QY61 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Irx4Q9QY61 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Irx4Q9QY61 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Irx4Q9QY61 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Irx4Q9QY61 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Irx4Q9QY61 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
Irx4Q9QY61 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Irx4Q9QY61 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Irx4Q9QY61 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Irx4Q9QY61 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Irx4Q9QY61 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Irx4Q9QY61 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Irx4Q9QY61 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Irx4Q9QY61 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Irx4Q9QY61 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Irx4Q9QY61 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Irx4Q9QY61 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Irx4Q9QY61 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms