RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000139005.1

Hoxd3os1-202, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd3os1, Length 1,701 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa27.49■■□□□ 1.99
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Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Abcc9P70170 1546 aa26.16■■□□□ 1.78
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 ScribQ80U72 1612 aa25.42■■□□□ 1.66
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Kdm5dQ62240 1548 aa24.49■■□□□ 1.51
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 NacadQ5SWP3 1504 aa24.43■■□□□ 1.5
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Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Sycp2Q9CUU3 1500 aa24.01■■□□□ 1.43
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 BicraF8VPZ9 1578 aa23.78■■□□□ 1.4
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa23.59■■□□□ 1.37
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Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Baz1aO88379 1555 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Rhox8Q6VSS7 320 aa23.16■■□□□ 1.3
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ccdc180J3QNE4 1664 aa23.15■■□□□ 1.3
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Crybg2B7ZCC2 1516 aa22.99■■□□□ 1.27
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Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ercc6F8VPZ5 1481 aa22.53■■□□□ 1.2
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Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Fam135aQ6NS59 1506 aa22.38■■□□□ 1.17
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Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Frmpd1A2AKB4 1549 aa22.28■■□□□ 1.16
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Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Unc13aQ4KUS2 1712 aa22.15■■□□□ 1.14
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Rtl1Q7M732 1744 aa22.14■■□□□ 1.13
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Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa21.96■■□□□ 1.11
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Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ubl4bQ9CQ84 188 aa21.89■■□□□ 1.09
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Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Efcab5A0JP43 1406 aa20.41■□□□□ 0.86
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa20.39■□□□□ 0.85
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Magi3Q9EQJ9 1476 aa20.39■□□□□ 0.85
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Grin2aP35436 1464 aa20.36■□□□□ 0.85
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Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Fgd6Q69ZL1 1399 aa20.2■□□□□ 0.83
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