RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000068056.11

Ddx39b-201, Transcript of Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ddx39b, Length 1,739 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Aifm3Q3TY86 605 aa23.14■■□□□ 1.3
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Ddx39b-201ENSMUST00000068056 NmiO35309 314 aa23.13■■□□□ 1.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ttc5Q99LG4 440 aa23.13■■□□□ 1.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gja10Q9WUS4 505 aa23.13■■□□□ 1.29
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Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Speer4aF8VPX6 267 aa23.13■■□□□ 1.29
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Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Znf428Q8C1M2 176 aa23.1■■□□□ 1.29
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ehd4Q9EQP2 541 aa23.1■■□□□ 1.29
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Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Nup188Q6ZQH8 1759 aa23.07■■□□□ 1.28
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Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ripor2Q80U16 1078 aa23.07■■□□□ 1.28
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Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ttc14Q9CSP9 761 aa23.05■■□□□ 1.28
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Col5a2Q3U962 1497 aa23.04■■□□□ 1.28
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Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Sde2Q8K1J5 448 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Greb1lB9EJV3 1913 aa23.04■■□□□ 1.28
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Trim34bJ3QNR8 485 aa23.03■■□□□ 1.28
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Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Sf3b3Q921M3 1217 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Fam122aQ9DB52 284 aa23.03■■□□□ 1.28
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Btaf1E9QAE3 1848 aa23.03■■□□□ 1.28
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Flt1P35969 1333 aa23.03■■□□□ 1.28
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ttc41Q692V3 1318 aa23.03■■□□□ 1.28
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Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Chrna5Q2MKA5 467 aa22.99■■□□□ 1.27
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Pcsk7Q61139 770 aa22.99■■□□□ 1.27
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Insm1Q63ZV0 521 aa22.99■■□□□ 1.27
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Stk32bQ9JJX8 414 aa22.99■■□□□ 1.27
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Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Kif2cQ922S8 721 aa22.98■■□□□ 1.27
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Dydc2Q9D3X8 139 aa22.98■■□□□ 1.27
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Grm8P47743 908 aa22.97■■□□□ 1.27
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Znf330Q922H9 316 aa22.97■■□□□ 1.27
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 UvssaQ9D479 717 aa22.97■■□□□ 1.27
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Znf609Q8BZ47 1413 aa22.97■■□□□ 1.27
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Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Lgr5Q9Z1P4 907 aa22.96■■□□□ 1.27
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Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Myo3bQ1EG27 1305 aa22.92■■□□□ 1.26
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Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Myoz2Q9JJW5 264 aa22.92■■□□□ 1.26
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Map3k15A2AQW0 1331 aa22.92■■□□□ 1.26
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Mical3Q8CJ19 1993 aa22.91■■□□□ 1.26
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 HlfQ8BW74 295 aa22.91■■□□□ 1.26
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 CpvlQ9D3S9 478 aa22.91■■□□□ 1.26
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gdf11Q9Z1W4 405 aa22.91■■□□□ 1.26
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