RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000046095.9

Vsx1-201, Transcript of Visual system homeobox 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vsx1, Length 3,791 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tbc1d31Q6NXY1 996 aa14.66□□□□□ -0.06
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Bcl11bQ99PV8 884 aa14.66□□□□□ -0.06
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Anp32eP97822 260 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tmem67Q8BR76 992 aa14.66□□□□□ -0.06
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tbc1d7Q9D0K0 293 aa14.66□□□□□ -0.06
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Hoxc9P09633 260 aa14.65□□□□□ -0.06
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Grm8P47743 908 aa14.65□□□□□ -0.06
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Sh3bp1P55194 680 aa14.65□□□□□ -0.06
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gtf2f1Q3THK3 508 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ms4a2P20490 235 aa14.65□□□□□ -0.06
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Prpf4bQ61136 1007 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Soga3Q6NZL0 945 aa14.65□□□□□ -0.06
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Lrrfip2Q91WK0 415 aa14.65□□□□□ -0.06
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Sgsm2Q80U12 1005 aa14.65□□□□□ -0.06
Vsx1-201ENSMUST00000046095 GckrQ91X44 587 aa14.65□□□□□ -0.06
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Stx1aO35526 288 aa14.64□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Oxsr1Q6P9R2 527 aa14.64□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ano10Q8BH79 659 aa14.64□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Frat2Q8K025 231 aa14.64□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Plcd1Q8R3B1 756 aa14.64□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Me1P06801 572 aa14.64□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Add3Q9QYB5 706 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Neurl4Q5NCX5 1563 aa14.64□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Igflr1Q3U4N7 345 aa14.64□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rps6kb1Q8BSK8 525 aa14.64□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Snw1Q9CSN1 536 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Hecw1Q8K4P8 1604 aa14.64□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Uri1Q3TLD5 531 aa14.63□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rufy2Q8R4C2 606 aa14.63□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Zkscan4Q5SZT6 480 aa14.63□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Taf5lQ91WQ5 589 aa14.63□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Kidins220E9Q9B7 1793 aa14.63□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Map7d2A2AG50 781 aa14.63□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Mcm6P97311 821 aa14.63□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rhot2Q8JZN7 620 aa14.63□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Pcdhb15Q91Y04 786 aa14.63□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Elf2Q9JHC9 593 aa14.63□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 TefQ9JLC6 301 aa14.63□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 PtprtQ99M80 1454 aa14.63□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Dnajc25A2ALW5 357 aa14.62□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Zscan29E9Q5B4 869 aa14.62□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Dync1i1O88485 628 aa14.62□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ttc19Q8CC21 365 aa14.62□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tmem94Q7TSH8 1360 aa14.62□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ccdc112A0AUP1 442 aa14.62□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Bend3Q6PAL0 825 aa14.62□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ccdc82Q6PG04 518 aa14.62□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Kansl3A2RSY1 903 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Slc35g1Q8BY79 368 aa14.62□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Mrpl44Q9CY73 333 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 4930548H24RikQ9D496 437 aa14.62□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Dnajc10Q9DC23 793 aa14.62□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 NhsB1AV60 1647 aa14.62□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa14.61□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Stxbp4Q9WV89 557 aa14.61□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa14.61□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cyp2d11P24457 504 aa14.61□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Eif4a1P60843 406 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Timm10P62073 90 aa14.61□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Spag5Q7TME2 1165 aa14.61□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ptcd1Q8C2E4 695 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Lamb3Q61087 1168 aa14.61□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Kank4Q6P9J5 1016 aa14.61□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Zfp113Q8C689 439 aa14.61□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Pus3Q9JI38 481 aa14.61□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 1700113H08RikE9Q9Q5 327 aa14.6□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 NmiO35309 314 aa14.6□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Fkbp5Q64378 456 aa14.6□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Abca8bQ8K440 1620 aa14.6□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tpm3-rs7D3Z2H9 248 aa14.6□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Prl7a2O54831 253 aa14.6□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Prkab2Q6PAM0 271 aa14.6□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ppp1r10Q80W00 888 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Zfyve16Q80U44 1528 aa14.6□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Znf568E9PYI1 671 aa14.6□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Atf5O70191 283 aa14.6□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Samsn1P57725 372 aa14.6□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Paxbp1P58501 919 aa14.6□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Fam84aQ9D650 292 aa14.6□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Atp10aO54827 1508 aa14.6□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 FancaQ9JL70 1439 aa14.6□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Atp2b1G5E829 1220 aa14.59□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Irx2P81066 474 aa14.59□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Bag1Q60739 355 aa14.59□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rab3gap1Q80UJ7 981 aa14.59□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 U2af1l4Q8BGJ9 220 aa14.59□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tmco3Q8BH01 678 aa14.59□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tmc2Q8R4P4 888 aa14.59□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Prex1Q69ZK0 1650 aa14.59□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Adora1Q60612 326 aa14.59□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 AidaQ8C4Q6 305 aa14.59□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Mtmr3Q8K296 1196 aa14.59□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Astn2Q80Z10 1352 aa14.59□□□□□ -0.07
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Kiaa0556Q8C753 1610 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32 ms