Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
Sh3bp1P55194 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Sh3bp1P55194 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Sh3bp1P55194 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Sh3bp1P55194 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Sh3bp1P55194 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Sh3bp1P55194 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Sh3bp1P55194 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Sh3bp1P55194 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Sh3bp1P55194 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Sh3bp1P55194 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Sh3bp1P55194 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Sh3bp1P55194 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Sh3bp1P55194 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Sh3bp1P55194 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Sh3bp1P55194 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Sh3bp1P55194 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Sh3bp1P55194 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Sh3bp1P55194 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Sh3bp1P55194 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Sh3bp1P55194 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Sh3bp1P55194 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Sh3bp1P55194 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Sh3bp1P55194 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Sh3bp1P55194 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Sh3bp1P55194 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Sh3bp1P55194 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Sh3bp1P55194 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Sh3bp1P55194 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Sh3bp1P55194 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Sh3bp1P55194 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Sh3bp1P55194 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Sh3bp1P55194 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Sh3bp1P55194 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Sh3bp1P55194 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Sh3bp1P55194 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Sh3bp1P55194 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Sh3bp1P55194 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Sh3bp1P55194 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Sh3bp1P55194 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Sh3bp1P55194 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Sh3bp1P55194 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Sh3bp1P55194 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Sh3bp1P55194 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Sh3bp1P55194 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Sh3bp1P55194 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Sh3bp1P55194 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Sh3bp1P55194 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Sh3bp1P55194 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Sh3bp1P55194 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Sh3bp1P55194 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Sh3bp1P55194 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sh3bp1P55194 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Sh3bp1P55194 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sh3bp1P55194 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sh3bp1P55194 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Sh3bp1P55194 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sh3bp1P55194 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sh3bp1P55194 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Sh3bp1P55194 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sh3bp1P55194 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Sh3bp1P55194 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Sh3bp1P55194 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Sh3bp1P55194 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sh3bp1P55194 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Sh3bp1P55194 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sh3bp1P55194 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sh3bp1P55194 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sh3bp1P55194 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sh3bp1P55194 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Sh3bp1P55194 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sh3bp1P55194 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Sh3bp1P55194 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sh3bp1P55194 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Sh3bp1P55194 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sh3bp1P55194 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Sh3bp1P55194 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Sh3bp1P55194 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sh3bp1P55194 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sh3bp1P55194 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sh3bp1P55194 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sh3bp1P55194 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sh3bp1P55194 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sh3bp1P55194 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sh3bp1P55194 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sh3bp1P55194 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sh3bp1P55194 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sh3bp1P55194 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sh3bp1P55194 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Sh3bp1P55194 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sh3bp1P55194 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sh3bp1P55194 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sh3bp1P55194 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sh3bp1P55194 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Sh3bp1P55194 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sh3bp1P55194 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sh3bp1P55194 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sh3bp1P55194 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Sh3bp1P55194 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Sh3bp1P55194 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms