Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Irx2P81066 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Irx2P81066 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Irx2P81066 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Irx2P81066 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Irx2P81066 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Irx2P81066 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Irx2P81066 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Irx2P81066 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Irx2P81066 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Irx2P81066 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Irx2P81066 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Irx2P81066 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Irx2P81066 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Irx2P81066 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Irx2P81066 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Irx2P81066 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Irx2P81066 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Irx2P81066 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Irx2P81066 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Irx2P81066 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Irx2P81066 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Irx2P81066 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Irx2P81066 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Irx2P81066 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Irx2P81066 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Irx2P81066 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Irx2P81066 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Irx2P81066 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Irx2P81066 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Irx2P81066 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Irx2P81066 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Irx2P81066 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Irx2P81066 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Irx2P81066 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Irx2P81066 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Irx2P81066 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Irx2P81066 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Irx2P81066 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Irx2P81066 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Irx2P81066 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Irx2P81066 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Irx2P81066 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Irx2P81066 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Irx2P81066 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Irx2P81066 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Irx2P81066 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Irx2P81066 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Irx2P81066 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Irx2P81066 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Irx2P81066 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Irx2P81066 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Irx2P81066 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Irx2P81066 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Irx2P81066 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Irx2P81066 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Irx2P81066 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Irx2P81066 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Irx2P81066 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Irx2P81066 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Irx2P81066 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Irx2P81066 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Irx2P81066 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Irx2P81066 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Irx2P81066 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Irx2P81066 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Irx2P81066 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Irx2P81066 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Irx2P81066 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Irx2P81066 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Irx2P81066 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Irx2P81066 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Irx2P81066 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Irx2P81066 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Irx2P81066 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Irx2P81066 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Irx2P81066 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Irx2P81066 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Irx2P81066 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Irx2P81066 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Irx2P81066 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Irx2P81066 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Irx2P81066 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Irx2P81066 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Irx2P81066 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Irx2P81066 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Irx2P81066 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Irx2P81066 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Irx2P81066 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Irx2P81066 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Irx2P81066 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Irx2P81066 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Irx2P81066 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Irx2P81066 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Irx2P81066 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Irx2P81066 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Irx2P81066 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Irx2P81066 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Irx2P81066 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Irx2P81066 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms